2024年3月1日更新 推薦直接用最近的新軟件PanDepth[https://github.com/HuiyangYu/PanDepth]，C語言寫的，速度很快。 以下為舊...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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二代測(cè)序通過bam文件統(tǒng)計(jì)深度和覆蓋度 -
「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第三課: 如何對(duì)SNP位點(diǎn)進(jìn)行過濾
往期教程 「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第一課: 對(duì)SNP位點(diǎn)進(jìn)行注釋 「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖 SNP位點(diǎn)過濾 SNP過濾有兩種情況，一種是僅根據(jù)位點(diǎn)質(zhì)...
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跟著Cell學(xué)作圖：R語言ggplot2作圖展示差異表達(dá)的基因一組對(duì)照加處理這種實(shí)驗(yàn)的差異表達(dá)分析結(jié)果通常是用火山圖來展示，如果是很多組實(shí)驗(yàn)的話如何展示，這種情況我之前還沒有遇到過。公眾號(hào)后臺(tái)有讀者留言問到了如下的圖 這個(gè)圖來自于論文A...
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R語言之tidyverse包安裝瀏覽了各大網(wǎng)站關(guān)于tidyverse包的安裝，初步安裝成功，教程分享如下，如有不正確的地方還請(qǐng)多多指教 第一步：下載tidyverse包，鏈接：https://cran.r-...
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2020-12-17水稻、小麥GO富集分析RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達(dá)基因，然后針對(duì)篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進(jìn)行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
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Chip-seq學(xué)習(xí)記錄關(guān)于概念問題，很重要 第1篇：ATAC-seq的背景介紹以及與ChIP-Seq的異同https://mp.weixin.qq.com/s/gLcNZkzzQI4AvZs-0D...
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使用clusterProfiler包對(duì)非模式生物進(jìn)行GO和KEGG的富集分析
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個(gè)強(qiáng)大的能進(jìn)行多種功能富集的R包，對(duì)于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進(jìn)行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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使用Atom的Snippet加速編碼
我們經(jīng)常需要對(duì)二維數(shù)組進(jìn)行迭代，比如這樣： 過上一段時(shí)間，你又要寫這么一段代碼： 如果你是程序員，那么你理應(yīng)厭煩：又一次重復(fù)得輸入for,[],{}……而且一個(gè)不小心，還很容...
