第四周 2018— 06.11-06.17原文： chromVAR: Inferring transcription factor-associated accessibil...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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Week4— chromVAR:預(yù)測(cè)染色質(zhì)可及性相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子 -
原核非已知轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)和可能結(jié)合的基因預(yù)測(cè)已有： 知道某原核生物某轉(zhuǎn)錄因子的DNA序列 目標(biāo)基因的基因組測(cè)序數(shù)據(jù) 另外還有這個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的靶基因的ORF序列 目的：1、分析該轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。2、分析該轉(zhuǎn)錄因子可能作用...
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【生信課程】03-序列比較-山東大學(xué)-生物信息學(xué)序列比較 認(rèn)識(shí)序列 FASTA 格式，第一行是一個(gè)大于號(hào)“>”開(kāi)頭，后面緊接注釋信息 序列相似性 相似的序列》相似的結(jié)構(gòu)》相似的功能 一致度如果兩個(gè)序列長(zhǎng)度相同，那么它們的一...
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Motif和domain的區(qū)別Protein domain： 結(jié)構(gòu)域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定義結(jié)構(gòu)域?yàn)榭梢宰詣?dòng)折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單位。過(guò)去，結(jié)構(gòu)域被描述為，折疊單位，致密結(jié)...
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R語(yǔ)言學(xué)習(xí)筆記之熱圖繪制TaoYan 簡(jiǎn)介 本文將繪制靜態(tài)與交互式熱圖，需要使用到以下R包和函數(shù)：heatmap():用于繪制簡(jiǎn)單熱圖的函數(shù)heatmap.2():繪制增強(qiáng)熱圖的函數(shù)d3heatma...
