整理畢業(yè)論文數據的時候，想將RNA-seq上游的一些分析結果可視化，主要是比對和定量的結果，通過圖表展示反而沒有那么直觀，經過一番摸索，最后畫出了下面的圖。 如有問題，請多多...
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R繪圖|轉錄組上游分析結果可視化-雙向柱狀圖 -
STRING數據庫的蛋白質相互作用（PPI）網絡分析在轉錄調控相關的文獻中，我們經常能夠看到這樣的蛋白質相互作用網絡（protein protein interaction network，PPI network）。具體而言，...
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跟著Nature Genetics學作圖：使用ggarrange包對ggplot2的多個圖進行組合論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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【機器學習與R語言】13- 如何提高模型的性能？1.調整模型參數來提高性能 參數調整：調節(jié)模型合適的選項的過程，如股票C5.0決策樹模型中的trials參數，神經網絡中的調節(jié)節(jié)點、隱層數目，SVM中的核函數等等。 care...
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轉錄組差異分析金標準-Limma-voom實戰(zhàn)劉小澤寫于19.3.11Limma作為差異分析的“金標準”最初是應用在芯片數據分析中，voom的功能是為了RNA-Seq的分析產生的。詳細探索一下limma的功能吧本次的測試...
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【動植物研究動態(tài)】20220529文獻解讀
Cell | 黃學輝/黃三文/韓斌/李家洋受邀發(fā)表作物馴化育種的遺傳學研究綜述[https://mp.weixin.qq.com/s/l2GEq3V9oUPhETPs7FnQ...
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R語言：利用邏輯回歸算法預測個人是否會出現違約行為本期在R語言中使用邏輯回歸算法建立模型預測個人是否會出現違約行為，協(xié)助銀行決策是否給予貸款，以達到降低銀行貸款壞賬的風險 數據基本情況 本文中所使用的數據來源于kaggle,...
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轉錄組數據定量歸一化
作者：二十八畫生審稿：童蒙編輯：amethyst 引言 經常看到類似的提問：轉錄組測序分析中FPKM和TPM哪個歸一化方法好？小編并不盲從，此前一直使用FPKM，Nature...
