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2026-01-08
Row data質(zhì)控 bwa比對參考基因組 利用GATK進(jìn)行SNP Calling
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安裝Rcurl提示ERROR: configuration failed for package 'RCurl'
使用ROOT用戶apt-get install libcurl4-gnutls-dev即可
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利用python爬蟲，獲取玉米不同基因組下載鏈接當(dāng)我們打開https://download.maizegdb.org/[https://download.maizegdb.org/]網(wǎng)站時(shí)，我...
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Mfuzz包K-means做趨勢圖
利用Mfuzz做趨勢圖已經(jīng)是很多人做過的教程了，但是也存在一個(gè)坑，特別是后面的可視化，這里給大家排排坑。 創(chuàng)建 ExpressionSet 對象...
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三代測序數(shù)據(jù)的比對與大片段插入檢測
最近做了三代測序（ONT），用于檢測特定區(qū)段是否存在大片段的插入缺失，整個(gè)流程主要用到了minimap2和delly。 第一步：使用minima...
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RNA-Seq數(shù)據(jù)分析----帶你從Row data到基因表達(dá)量
以Sample1-6的6個(gè)樣品為例，二代雙末端測序 （Sample1-fq_1.gz Sample1-fq_2.gz ... Sample6-...
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實(shí)例（針對長染色體無法建立index導(dǎo)致bw文件生成失敗）
寫在前面: 本流程以染色體較長的黑麥基因組為例，每條染色體達(dá)到1Gb左右。 Correspond e-maile: liuxw01@126.co...