加權(quán)基因表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA），又叫權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，其根本思想是根據(jù)基...
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WGCNA:加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
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常用生物信息學(xué)格式介紹(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)前言 在各個(gè)行業(yè)都是有行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的，這樣才能統(tǒng)一規(guī)范而方便后面的分析，在生物信息學(xué)領(lǐng)域中主要是各種大量序列數(shù)據(jù)、注釋數(shù)據(jù)等，這些都是有特定的格式去表示，下面列舉幾種常見的格式。...
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CeRNA才是人生贏家，一篇著名的赤果果的文(tao)獻(xiàn)(lu)ceRNA是個(gè)啥？ 首先肯定要先搞清楚ceRNA是個(gè)啥，英文名competing endogenous RNAs，咱給翻譯成——競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA。其實(shí)簡(jiǎn)單去理解只要理解一個(gè)核...
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3.轉(zhuǎn)錄組 | 富集分析（clusterProfiler）基因富集分析 (gene set enrichment analysis)：在一組基因或蛋白中找到過(guò)表達(dá)的基因或蛋白。 常用的注釋數(shù)據(jù)庫(kù)：①GO( The Gene Onto...
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加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)（WGCNA）尋找與疾病相關(guān)的hub基因WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達(dá)的基因模塊(module)，并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)，以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)模式...
