1. 認識序列。 序列（sequence）： 就是字符串（string） s=abcdefghijklmnopqrstuvwxyz 通常用 代表...
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（一）序列比對 -
從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程這篇文章很長，超過1萬字，是本系列中最重要的一篇，因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀，對于有一定...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第2節(jié) FASTA和FASTQ在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中，我們會接觸到許多生物信息學(xué)/基因組學(xué)領(lǐng)域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) DNA測序技術(shù)前言 基因測序已是時下熱門，目前除了華大基因之外，其他分布于全中國的大型測序平臺（HiSeq X 10）還有約10個，每個每年大概能完成1.8萬...
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學(xué)習(xí)生物信息，我都應(yīng)該掌握那些內(nèi)容？持續(xù)更新ing.....最后更新時間：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限： eg： 7=4...
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GO和Pathway富集分析的背景基因集
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析時，都會涉及到 Background; 做分析時，分析工具會提供一些數(shù)據(jù)供使用者選擇或者使用自定義...
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小白使用GSEA的注意事項最近看文獻的時候GSEA分析的出現(xiàn)頻率太高了，我想我是不是也該學(xué)習(xí)一下。帖子看了不少，官方的user guide也看了，但是一直有個揮之不去的困...
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featureCounts統(tǒng)計counts后的cpm和tpm計算
該腳本適用于featureCounts數(shù)counts后的cpm和tpm計算 setwd("~/Desktop")#設(shè)置工作目錄 countdat...
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RPM(CPM)/RPKM/FPKM/TPMRPM/RPKM/FPKM/TPM是我們在定義表達量時常用的幾種計算方式，那么究竟有什么區(qū)別呢？ RPM/CPM RPM/CPM: Reads/...
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0?? 序列比對的概念
序列比對和序列特征分析總目錄 序列比對的根本是發(fā)現(xiàn)潛在的同源序列，為所查詢的序列進行功能預(yù)測及三維結(jié)構(gòu)建模奠定基礎(chǔ)。 序列比對sequence ...
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