1 比對的是：使用idba_ud拼接的AER314-4raw_data基因組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。 2 bowtie2做index（bowtie2使用c...
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tophat軟件比對-實(shí)戰(zhàn)（2018-05-29） -
tophat軟件比對-測試（2018-05-28）
1 比對的是：相似菌參考基因和使用seqtk隨機(jī)抽取出來的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。 2 bowtie2做index 1）使用方法： bowtie2-buil...
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用tophat和cufflinks分析RNAseq數(shù)據(jù)(2018-05-28)
轉(zhuǎn)自：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=635619&do=blog&id=88...
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為什么說FPKM和RPKM都錯了？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文，一些偶然的機(jī)會，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題，因此我重新做了梳理并發(fā)出來。這樣的討論是有益的，放在今天...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)淼氖?6年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level e...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1727491/1551615516.jpg', '推薦專題《RNA-Seq》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/0b0773fec90e?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}