介紹 做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗(yàn)證二代測(cè)序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對(duì)表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法...
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數(shù)據(jù)分析：RT-qPCR分析 -
實(shí)驗(yàn)技術(shù)（2）——引物設(shè)計(jì)相關(guān)【進(jìn)入正題】 前面提到的幾個(gè)探究蛋白互作相關(guān)的實(shí)驗(yàn)，其實(shí)第一步都需要構(gòu)建合適的質(zhì)粒，那么就少不了設(shè)計(jì)靠譜的引物了。 通常來說，引物的設(shè)計(jì)需要遵守...
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數(shù)據(jù)分析：基于DESeq2結(jié)果的基因富集分析介紹 DESeq2常用于識(shí)別差異基因，它主要使用了標(biāo)準(zhǔn)化因子標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)，再根據(jù)廣義線性模型判別組間差異（組間殘差是否顯著判斷）。在獲取差異基因結(jié)...
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生信格式之fasta、fastq要點(diǎn)一：fasta格式 1、目的 蛋白質(zhì)序列與核酸(DNA/RNA)序列研究是生命科學(xué)的核心，前者的組成單位為20種氨基酸，后者則是核苷酸(DN...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture...
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練習(xí)：基因家族
基因家族鑒定分析操作手冊(cè)： 基因家族 基因家族鑒定 基因家族鑒定分析總結(jié) 1.下載基因組信息文件，gff，cds，pep，fasta文件： En...
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TBtools | 只有序列，怎么做基因結(jié)構(gòu)圖?寫在前面 這兩天有看到幾個(gè)用戶朋友在生信札記討論群中討論了基因結(jié)構(gòu)圖的繪制?？吹狡渌脩粢恢蓖扑] GSDS，我便也沒有作聲，畢竟 GSDS 確實(shí)...
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高速！大規(guī)模 (10w+) 基因?qū)?Ka/Ks 計(jì)算工具 - TBtools寫在前面 目前還是在繼續(xù)整一些擦邊“比較基因組”的工具。前段時(shí)間停下來，原因只有一個(gè)：我發(fā)現(xiàn) TBtools 的Simple Ka/Ks Cal...
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