導(dǎo)讀 用R軟件corr.test函數(shù)進(jìn)行兩組數(shù)組的相關(guān)性分析，用Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖。 一、輸入數(shù)據(jù) 代謝數(shù)據(jù)：metabo.txt...
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Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖 -
【簡(jiǎn)單掌握】不同基因表達(dá)間的相關(guān)系數(shù)計(jì)算及作圖相關(guān)系數(shù)計(jì)算：相關(guān)系數(shù)、P值 相關(guān)系數(shù)作圖 補(bǔ)充ggcorrplot 更詳細(xì)的作圖細(xì)節(jié)可參考：http://www.itdecent.cn/p...
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R語(yǔ)言計(jì)算兩組數(shù)據(jù)變量之間相關(guān)系數(shù)和P值的簡(jiǎn)單小例子最近在看植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA的內(nèi)容，數(shù)據(jù)分析里有個(gè)一內(nèi)容是預(yù)測(cè)lncRNA的反式作用元件，通常的做法是利用表達(dá)量數(shù)據(jù)計(jì)算皮爾遜相關(guān)系數(shù)，然后設(shè)置...
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六. 基因表達(dá)相關(guān)性分析與作圖（R語(yǔ)言“corrplot”包）一. 簡(jiǎn)介 corrplot包是一個(gè)畫相關(guān)系數(shù)圖的包，可以用來(lái)對(duì)基因的表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，分析不同基因間表達(dá)的相關(guān)性。 二. 實(shí)例 1. 數(shù)據(jù)格式...
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RNA-Seq分析過(guò)程：從FASTQ到圖
Ref: Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by ...
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（六）：GO、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略本節(jié)概覽：1.獲取DEG結(jié)果的上下調(diào)差異基因2.bitr()函數(shù)轉(zhuǎn)化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進(jìn)行KEGG...
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差異分析|使用limma包獲取本章節(jié)數(shù)據(jù)和代碼：關(guān)注微信公眾號(hào)：小杜的生信筆記（ID：Du_Bioinformatics），回復(fù)關(guān)鍵詞：limma差異分析 -------...
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Clusterprofiler的一些技巧一、獲得注釋包中的GO信息 二、下載最新的KEGG數(shù)據(jù)庫(kù) 三、將GOid轉(zhuǎn)化為term 四、計(jì)算詞條相似性 計(jì)算相似性的原理可以參考：https...
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RNAseq常規(guī)流程轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個(gè)基礎(chǔ)和常見(jiàn)的分析流程，一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開(kāi)始，經(jīng)過(guò)一系列的質(zhì)控，基因組比對(duì)，差異分析等過(guò)程得到實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組（或者腫瘤中的...
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RNA-seq數(shù)據(jù)的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析劉小澤寫于18.10.24最近開(kāi)始寫第一篇英文小論文，練練手，為將來(lái)寫英文大論文做準(zhǔn)備 目錄 1 背景 Background Types of ...
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