在學習基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相、單倍體分型），主要是參考公眾號堿基礦工中的一篇文章：人類基因組的Phasing原...
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用Beagle做基因型填充（Imputation） -
我的GWAS學習筆記上個月中旬，出于對GWAS的好奇，我參加了一個培訓班，之后又花了一周的時間來整理聽課筆記，感覺現(xiàn)在對GWAS已經(jīng)有了一個比較全面的認識。 在ca...
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群體遺傳中基于SNP的PCA分析
基于群體遺傳中變異信息文件VCF來分析PCA 第一種方法 可以使用plink軟件直接進行分析 plink --vcf all_genotypeg...
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群體進化-GWAS分析
群體進化-gwas分析 群體進化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分...
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somatic和germline突變somatic突變是體細胞突變。主要側(cè)重比較的是正常組織和患病組織的體細胞突變。體細胞在復制的過程中，發(fā)生了突變，導致這種體細胞突變。更偏重于單...
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SNP功能注釋網(wǎng)站合集這篇文章是對SNP位點功能注釋在線網(wǎng)站的一個總結(jié)帖。 軟件排名不分先后，優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。 彩蛋在最后，請堅持看完 1、GWAS4D, 推...
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