說在前面 相信大家在平時做富集分析時都會有這樣的一個需求：如果能知道感興趣的某條通路中各基因的調(diào)控關(guān)系，那么就能準(zhǔn)確識別出hub基因；或者說找到...
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CBNplot：可視化富集通路中基因的調(diào)控關(guān)系 -
GSE120974多組學(xué)分析復(fù)現(xiàn)0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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跟著Nature學(xué)作圖:R語言ggplot2環(huán)形堆積柱形圖完整示例論文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of t...
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RNA編輯：相關(guān)數(shù)據(jù)庫和分析軟件REDItools數(shù)據(jù)庫： 1.DARNED：https://darned.ucc.ie/包含大約42000個人類基因組坐標(biāo)的信息。 2.RADAR：http:/...
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NCBI公共數(shù)據(jù)庫下載10x單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析的全流程參考生信技能書一文打通單細(xì)胞上游：從軟件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqj...
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網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)與人工智能 | Awesome-GNN
2020/7/9，第一次更新，本文將總結(jié)筆者的研究方向一"多組學(xué)智能醫(yī)療"的子方向"網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)與人工智能"的分支——圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Graph Ne...
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從「Read.fq.gz」到「SNP.vcf」？我用 TBtools 點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)就整完了~[準(zhǔn)備花3天時間，寫這個推文] 寫在前面 前述提及，重測序數(shù)據(jù)分析上游常用軟件三兄弟已經(jīng)聚齊，于是所有用戶可以在 Windows 下進(jìn)行重測序數(shù)...
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iTAK：在線預(yù)測全基因組轉(zhuǎn)錄因子TF，轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學(xué)，F(xiàn)eiLab的一個預(yù)測工具。 iTAK 是依賴于數(shù)據(jù)庫的用于從蛋白質(zhì)或核苷酸序列中識別植物轉(zhuǎn)錄因子 (TF)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子 (...
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qiime2R包整合qiime2和R可視化分析16s數(shù)據(jù)
背景：qiime artifact 是用于存儲qiime2的輸入輸出以及相關(guān)的元數(shù)據(jù)，并提供結(jié)果是如何產(chǎn)生的信息，但是qiime2所產(chǎn)生的art...
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單細(xì)胞之軌跡分析-5：slingshot軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] ...
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