寫在前面 目前，有大量物種的基因組序列和注釋信息公布。幾乎所有科研人員都可以下載并使用這些數(shù)據(jù)，分析和驗證自己的科研假設(shè)。常常，我們會遇到一些小...
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實用！便攜且高效 去除 基因組序列和注釋 碎片 -
可視化！Circos 圖繪制，更簡單更靈活更方便~寫在前面 為什么 TBtools 用起來舒服，相比于不少其他軟件，同質(zhì)非同質(zhì)的？我想了很久，可能原因之一，即“開發(fā)者即用戶本身”，簡單來說，“我...
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R語言ggplot2作圖的兩套配色方案備選第一個 在郵箱看到了蘋果的廣告郵件，這個HomePod mini是啥產(chǎn)品不太清楚，音響嗎？這個不管了，啥產(chǎn)品自己也買不起 哈哈哈，第一眼見到感覺...
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終于，我也出了篇R語言入門手冊！1 什么是R語言R語言是一個開源的數(shù)據(jù)分析環(huán)境，起初是由數(shù)位統(tǒng)計學(xué)家建立起來，以更好的進(jìn)行統(tǒng)計計算和繪圖，這篇wiki中包含了一些基本情況的介紹...
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新，文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上，在網(wǎng)上搜了一圈，關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的...
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可視化文章集錦(套路、配色、編輯、在線工具、R、CIRCOS、Cytoscape)
數(shù)據(jù)可視化是解析、理解和展示數(shù)據(jù)不可缺少的一部分。炫或不炫看個人喜好和功底，能否達(dá)意是最基本的要求---最合適的圖示和配色表達(dá)最直觀的含義。 本...
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CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進(jìn)化樹+啟動子圖的單獨或組合圖1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進(jìn)行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的...
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木薯KUP基因家族分析-基因組質(zhì)量差也擋不住基因家族鑒定分析 基因家族基因家族鑒定類文章為最經(jīng)濟(jì)最快速的發(fā)文思路，這里通過一篇2018年發(fā)表的木薯當(dāng)中的KUP基因家族鑒定分析的SCI來介紹下此類文章的行文思路。我們...
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物種內(nèi)共線性圈圖繪制，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了！整天有人問，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義？你想說談什么生物學(xué)故事？ 承認(rèn)...
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任何人！一鍵完成物種間的共線性分析與可視化寫在前面 類似的主題，我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性（MCScanX）分析》的文章。推出之后一部分人用著挺好。也有相當(dāng)部分朋友卻不知為...
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