目的：把兩組bed files 分別pool成一個bed file，而且疊加到序列區(qū)間要merge起來。合并：cat *.bed > outpu...
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如何合并兩個或多個bed files
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GWAS群體分層 (Population stratification)：利用plink對基因型進(jìn)行PCA
來源：https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/10484467.html感謝作者，拷過來做個筆記。 一、為什么...
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phesant（PHEnome Scan Analysis Tool）想著好久沒更新了，但我的粉絲們還是會經(jīng)常來看看我，所以，決定把最近學(xué)的東西掛出來。 搜了下中文網(wǎng)，幾乎沒有對這個方法進(jìn)行介紹的，一個可能是新出的...
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軟件應(yīng)用：PHESANT：用于自動化表型組掃描UK生物庫的工具書到用時方恨少，今天來學(xué)習(xí)一下英國生物數(shù)據(jù)庫中用于表型關(guān)聯(lián)分析的工具，以下主要內(nèi)容是對截圖所示文章的翻譯。 摘要 動機(jī)：流病隊列常常包含不同類型...
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GWAS - PRS多基因風(fēng)險評分計算學(xué)習(xí)筆記一、安裝PRSice（mac版） 經(jīng)試驗我覺得直接從git hub中下載對應(yīng)的安裝包是最快的：https://github.com/choish...
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PheWAS(全表型組關(guān)聯(lián)分析)----PheWAS的R包測試及分析(二)
由于上次寫完教程一后還有許多疑問還沒解決，在師兄的建議下看了一下R包中核心函數(shù)的源碼(到底在做什么回歸?)，大概解開了心中的部分疑惑。最近在看很...
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