本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，...
投稿
收錄了24篇文章 · 18人關(guān)注
-
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程 -
加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)（WGCNA）尋找與疾病相關(guān)的hub基因WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達(dá)的基因模塊(module)，并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)，以及網(wǎng)絡(luò)中的...
-
Tutorial for the WGCNA package for RI. Network analysis of liver expression data from female mice: finding m...
-
RNA-seq數(shù)據(jù)的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析劉小澤寫(xiě)于18.10.24最近開(kāi)始寫(xiě)第一篇英文小論文，練練手，為將來(lái)寫(xiě)英文大論文做準(zhǔn)備 目錄 1 背景 Background Types of ...
-
WGCNA構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)詳細(xì)教程這篇文章更多的是對(duì)于混亂的中文資源的梳理，并補(bǔ)充了一些沒(méi)有提到的重要參數(shù)，希望大家不會(huì)踩坑。 1. 簡(jiǎn)介 1.1 背景 WGCNA（weight...
-
呦呦切克鬧，WGCNA來(lái)一套劉小澤寫(xiě)于18.10.10很早就見(jiàn)過(guò)它，但只是不明覺(jué)厲，直到昨天才開(kāi)始認(rèn)真了解是這樣的：昨天上午看了一篇文獻(xiàn)，講冠心病的基因共表達(dá)分析，簡(jiǎn)而言之...
-
WGCNA+代碼實(shí)戰(zhàn)（持續(xù)補(bǔ)充中）什么是WGCNA 1 樣本聚類(lèi)，查看是否有離群值 2. 找構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)合適的閾值 左圖縱軸：相關(guān)系數(shù)的平方，越高說(shuō)明該網(wǎng)絡(luò)越逼近無(wú)網(wǎng)絡(luò)尺度的分布。右...
-
轉(zhuǎn)錄組專(zhuān)題-WGCNA分析
生信菜鳥(niǎo)團(tuán)https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mid=2247484540&id...
-
WGCNA
原理：WGCNA算法首先假定基因網(wǎng)絡(luò)服從無(wú)尺度分布，并定義基因共表達(dá)相關(guān)矩陣、基因網(wǎng)絡(luò)形成的鄰接函數(shù)，然后計(jì)算不同節(jié)點(diǎn)的相異系數(shù)，并據(jù)此構(gòu)建分層...
-
WGCNA分析--提升轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文章檔次的利器現(xiàn)在做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，看看差異基因，做做富集分析，再討論下差異基因功能與自己研究性狀或處理之間的關(guān)系，最后加簡(jiǎn)單的qPCR驗(yàn)證，這樣的數(shù)據(jù)發(fā)SCI影...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1781233/crop1559665982983.jpg', '推薦專(zhuān)題《WGCNA》（ 分享自 @簡(jiǎn)書(shū) ）','http://www.itdecent.cn/c/284c4f19f55b?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}