什么是泛基因組？ 2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語(yǔ)‘παν’，全部的意思），泛基因...
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認(rèn)識(shí)泛基因組測(cè)序
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Texshade對(duì)多重序列比對(duì)進(jìn)行可視化很早之前就覺(jué)得用DNAMAN做的多重比對(duì)導(dǎo)出來(lái)的圖不是很好看了，而且后期還要進(jìn)行PS或者PPT進(jìn)行修飾。 因此，到網(wǎng)上去找了一些方法也做了一些嘗...
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Chip-seq分析流程以Targeting super-enhancer-associated oncogenesin oesophageal squamous ce...
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【Fast ATAC protocol】減少線粒體DNA干擾(wet-2)
參考原文：http://www.nature.com/ng/journal/v48/n10/full/ng.3646.html#methods ...
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R語(yǔ)言批量爬取NCBI基因注釋數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)爬蟲(chóng)（web crawler），也叫網(wǎng)絡(luò)蜘蛛（spider），是一種用來(lái)自動(dòng)瀏覽萬(wàn)維網(wǎng)的網(wǎng)絡(luò)機(jī)器人。其目的一般為編纂網(wǎng)絡(luò)索引。各大搜索引擎都...
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R 學(xué)習(xí) - 火山圖歡迎關(guān)注生信寶典，獲取更好閱讀體驗(yàn)。 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=...
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#分子模擬#Pymol編譯安裝
Pymol可能不做分子模擬的同學(xué)也會(huì)比較熟悉，這個(gè)可視化界面可謂膾炙人口，雖然我們可以簡(jiǎn)單的使用sudo apt-get install pym...
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回車和換行在不同系統(tǒng)中的區(qū)別和匹配方式以前還真沒(méi)注意回車和換行有啥區(qū)別，直到。。。 那天我在windows下使用notepad下編輯一個(gè)小文本，用notepad的替換工具替換每一行的...
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NGSCheckMate: 驗(yàn)證相同和不同維度 NGS 數(shù)據(jù)的一致性
當(dāng)一個(gè) NGS 項(xiàng)目中對(duì)同一個(gè)樣本進(jìn)行了 WGS 和 RNA-seq 測(cè)序，或者對(duì)同一個(gè)腫瘤患者的腫瘤組織和癌旁組織同時(shí)進(jìn)行 WGS / WES...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)?lái)的是16年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level e...
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