新組裝的基因組并沒(méi)有上傳和生成RefSeq基因組信息。而且一系列需要or.db或者構(gòu)建or.db的步驟嘗試構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)都不成功，要么缺乏物種信息，...
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用clusterProfile進(jìn)行非模式物種且沒(méi)有參考基因組的GO和KEGG富集分析
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非模式物種的一種簡(jiǎn)單版的go，kegg富集首先推薦Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/[http://kobas.cbi.p...
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非模式生物基因GO富集分析：以水稻為例
模式生物做什么都簡(jiǎn)單，非模式生物則很多缺少注釋?zhuān)瑳](méi)有注釋你就沒(méi)法做，只能是借助于各種軟件比如blastgo，自己跑電子注釋。但今天要講的不是這種...
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從Uniprot那里得到對(duì)應(yīng)的擬南芥基因ID
最近有個(gè)需求，就是給定一個(gè)蛋白質(zhì)的ID號(hào)，就知道它是什么基因。比如說(shuō)O49397。但有個(gè)問(wèn)題是，我并不知道這是個(gè)什么東西，于是我就去搜了下。 發(fā)...
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