關(guān)于原理部分和更詳細(xì)的介紹，見HiC-Pro: Hi-C數(shù)據(jù)預(yù)處理高效工具[http://www.itdecent.cn/p/40ab8cb3...
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HiC-Pro的Singularity簡(jiǎn)明使用指南
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比較Hi-C數(shù)據(jù)分析的計(jì)算方法基于Hi-C數(shù)據(jù)的深層挖掘和多組學(xué)聯(lián)合分析已經(jīng)成為了三維基因組領(lǐng)域的重要組成部分。而工欲善其事必先利其器，夯實(shí)基礎(chǔ)方能壘砌高臺(tái)。染色質(zhì)構(gòu)象各個(gè)層...
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HiC數(shù)據(jù)預(yù)處理后一些輸出格式（整理中，歡迎補(bǔ)充）
Juicer的輸出文件: merged_nodups.txt read1的FLAG，對(duì)應(yīng)SAM的第二列，F(xiàn)LAG read1比對(duì)的contig，...
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三維基因組學(xué)研究之Hi-C1. 技術(shù)原理 基因組研究的維度可以分為很多種，例如下圖所示 其中Hi-C是研究三維結(jié)構(gòu)的一種方法。Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲（Chromo...
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Juicer:Hi-C數(shù)據(jù)處理分析（三）
從 .hic 文件提取數(shù)據(jù) 此功能由 Juicebox tools 的 dump 命令完成。https://github.com/aidenla...
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Juicer:Hi-C數(shù)據(jù)處理分析（二）寫在前面 上一章我們得到了 .hic文件，從上圖我們清楚的看出可以利用 juicer tools 對(duì).hic 文件進(jìn)行feature annot...
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Juicer:Hi-C數(shù)據(jù)處理分析（一）參考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for...
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02-Hi-C輔助基因組安裝基因組組裝 基因組是怎么組裝的，目前的方法有什么局限性？為什么要進(jìn)行基因組組裝？是因?yàn)槟壳暗臏y(cè)序方法，無論是一代、二代、三代都是借助于全基因組鳥...
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Hi-C數(shù)據(jù)質(zhì)控原理
作者：ahworld鏈接：Hi-C數(shù)據(jù)質(zhì)控原理來源：微信公眾號(hào)-seqyuan著作權(quán)歸作者所有，任何形式的轉(zhuǎn)載都請(qǐng)聯(lián)系作者。 Hi-C數(shù)據(jù)質(zhì)控原...
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Hi-C文獻(xiàn)解讀15年3月發(fā)表的一篇高引文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4542312/ Cite...
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