筆記回顧：1.GEO數(shù)據(jù)庫(kù)視頻學(xué)習(xí)筆記（芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀?。?.GEO數(shù)據(jù)庫(kù)視頻學(xué)習(xí)筆記（ID轉(zhuǎn)換）3.GEO數(shù)據(jù)庫(kù)視頻學(xué)習(xí)筆記（了解你的表...
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-第一期-膠質(zhì)母細(xì)胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mi...
首先是學(xué)習(xí)優(yōu)秀的帖子 最近處理數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)同一個(gè)平臺(tái)的RNA-seq或者芯片數(shù)據(jù)，不同的樣本之間有時(shí)候竟然存在很大的差異，也就是所謂的批次效應(yīng)。因此...
解讀GEO數(shù)據(jù)存放規(guī)律及下載，一文就夠 原創(chuàng) jimmy 生信技能樹(shù)-----解讀GEO數(shù)據(jù)存放規(guī)律及下載，一文就夠 - 做生物信息學(xué)分析的朋友...
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)-ID轉(zhuǎn)換系列(一) 作者：jzhang 前言：我們都知道很多人在進(jìn)行GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的時(shí)候，首先遇到的第一個(gè)痛點(diǎn)就是探針I(yè)D轉(zhuǎn)換成...
GEO數(shù)據(jù)分析之必備基礎(chǔ)知識(shí) 本節(jié)主要介紹GEO分析開(kāi)始之前的準(zhǔn)備工作和推薦學(xué)習(xí)以下非常優(yōu)秀的推文，學(xué)習(xí)之后GEO分析就春暖花開(kāi)了： 生信技能樹(shù)...
缺失值可視化 1.在GEO數(shù)據(jù)挖掘過(guò)程中，有時(shí)取子集會(huì)導(dǎo)致生成的子集都是NA。那么是因?yàn)榇a寫(xiě)錯(cuò)了，或者數(shù)據(jù)類型沒(méi)搞清，還有一種情況就是，數(shù)據(jù)集...
DNA微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析 基因表達(dá)數(shù)據(jù)反映的是直接或間接測(cè)量得到的基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 mRNA 在細(xì)胞中的豐度，這些數(shù)據(jù)可以用于分析哪些基因的表達(dá)...
保姆式GEO數(shù)據(jù)挖掘演示配對(duì)GEO數(shù)據(jù)分析GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文TCGAbiolinks做差異分析我的一個(gè)paired DEGs 的例子
GEO再學(xué)習(xí) GEO數(shù)據(jù)挖掘已經(jīng)成為生信學(xué)者必備技能,我以為自己會(huì)跑代碼了就是會(huì)了,其實(shí)呢,細(xì)細(xì)去領(lǐng)會(huì)每個(gè)細(xì)節(jié),還是會(huì)發(fā)現(xiàn)很多盲區(qū).聽(tīng)了曉娟老師...
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