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常見(jiàn)NGS匯總github
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應(yīng)該是最好的eggnog-mapper功能注釋教程eggnog-mapper實(shí)現(xiàn)功能注釋 eggNOG-Mapper介紹 通常功能注釋的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常見(jiàn)的方法就是BLA...
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變異檢測(cè)與其相應(yīng)的工具的選擇什么是基因組變異 基因組變異是一個(gè)定義比較模糊的概念。 所謂的變異是相對(duì)于一個(gè)完美的“參考基因組”而言。但是其實(shí)完美的“參考基因組”并不存在，因...
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基于全基因組的基因家族分析（3）：SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列獲取今天繼續(xù)進(jìn)行下一步，也是序列文件的獲取，有了這些數(shù)據(jù)，我們才可以進(jìn)行下一步的工作，才能夠繪制一些圖片。 1. CDS序列獲取 SlNRAMP家族...
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基于全基因組的基因家族分析（2）：SlNRAMP家族基因成員鑒定1.找到你所感興趣的基因家族 番茄（Solanum lycopersicum），最喜愛(ài)的蔬菜水果之一。摘錄維基百科最基本的介紹，詳細(xì)了解番茄的起...
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粳稻參考基因組ID轉(zhuǎn)換粳稻參考基因組日本晴主要常用的有兩個(gè)版本，分別為The Rice Annotation Project (RAP)（https://rapdb....
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WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號(hào)為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說(shuō)一下KPG...
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應(yīng)該是收集了水稻所有的ChIP-seq數(shù)據(jù)的一個(gè)網(wǎng)站Plantseq（含ChIP-seq部分分析及可視化命令腳本）Plantseq 首頁(yè)界面image.png看看更新頻率，你沒(méi)看錯(cuò)，前幾天才更新。。image.png隨便拿一個(gè)基因輸入看看（注意這里只支持RA...
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