Paper 2：轉(zhuǎn)錄組+miRNA+降解組相關(guān)文章 標(biāo)題：Integrated transcriptome, small RNA and deg...
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Paper 2：轉(zhuǎn)錄組+miRNA+降解組相關(guān)文章
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方便快捷的smallRNA數(shù)據(jù)分析流程前言 ??今天來(lái)跟大家分享一個(gè)smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiol...
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Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識(shí)（一）：15年玉米Ribosome profiling reveals dynamic translational landscape in maize seed...
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【ChIP-seq 實(shí)戰(zhàn)】五、合并bam和去除PCR重復(fù)
這里是佳奧！ 獲得了比對(duì)的bam文件，生成了index的bai文件，生成了比對(duì)結(jié)果stat文件。 合并bam文件和去除PCR重復(fù)沒(méi)有嚴(yán)格先后順序...
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RNA seq 標(biāo)準(zhǔn)化 不同方式
Normalization 差異基因分析工作流程的第一步是計(jì)數(shù)歸一化，這對(duì)于準(zhǔn)確比較樣品之間的基因表達(dá)是必需的。 RNA-Seq（RNA測(cè)序的縮...
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轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)六（reads計(jì)數(shù)與標(biāo)準(zhǔn)化）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（...
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DESeq2的多組比較
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org...
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bamtofastq 將bam文件轉(zhuǎn)成fastq文件目標(biāo) 通常比對(duì)好的bam，如果需要重新比對(duì)，需要將文件轉(zhuǎn)成原始的測(cè)序文件的格式fastq。通過(guò)bedtools中的bamtofastq 能夠?qū)⑽?..
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GSEA結(jié)果解讀
上一篇GSEA可以做什么[http://www.itdecent.cn/p/1cc9f6c20ef6]之后，繼續(xù)進(jìn)行結(jié)果解讀 1 Enrich...
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【ChIP-seq 實(shí)戰(zhàn)】七、可視化（IGV部分）這里是佳奧！ 獲得了peaks之后我們導(dǎo)入IGV檢查。 1 deeptools初探 bamCoverage的基本用法 得到的bw文件就可以送去I...
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