發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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scanpy框架用來(lái)分析bulkRNA就是好用scanpy作為單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具，熟悉python的人應(yīng)該并不陌生。因其是為復(fù)雜的單細(xì)胞數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)而來(lái)，所以用于分析bulkRNA數(shù)據(jù)有點(diǎn)降維打...
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AICelltype | 79個(gè)當(dāng)中表現(xiàn)最佳的大模型用于細(xì)胞類(lèi)型注釋單細(xì)胞RNA測(cè)序極大地豐富了我們對(duì)細(xì)胞異質(zhì)性的認(rèn)識(shí)。然而，準(zhǔn)確的細(xì)胞類(lèi)型標(biāo)注仍然是下游分析中的一個(gè)主要瓶頸。人工標(biāo)注耗時(shí)費(fèi)力，很大程度上依賴于專(zhuān)...
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claw4science | 大模型分析數(shù)據(jù)的技能庫(kù)前面體驗(yàn)過(guò)OmicClaw，感覺(jué)還不錯(cuò)，降低了分析數(shù)據(jù)對(duì)寫(xiě)代碼的直接依賴。對(duì)于不會(huì)代碼的研究人員來(lái)說(shuō)確實(shí)是一種福音，用自然語(yǔ)言即可通過(guò)AI操控底...
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OmicsClaw | 體驗(yàn)多組學(xué)分析人工智能研究助手自從OpenClaw爆火以后，生信分析方向也有不少關(guān)于組學(xué)數(shù)據(jù)分析的大模型AI Agent。作為趕時(shí)髦的生信工程師，肯定要湊個(gè)熱鬧，感受一下AI...
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liana+ | 整合多種細(xì)胞通訊方法和數(shù)據(jù)庫(kù)，這樣的軟件確實(shí)好用LIANA+ 是一個(gè)可擴(kuò)展的框架，能夠根據(jù)需要對(duì)現(xiàn)有方法和知識(shí)進(jìn)行調(diào)整和拓展，以研究單細(xì)胞、空間分辨率以及多模態(tài)組學(xué)數(shù)據(jù)中的細(xì)胞間通訊。它是 s...
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scdiffeq | 建模多時(shí)間點(diǎn)單細(xì)胞數(shù)據(jù)的發(fā)育軌跡單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)通過(guò)捕獲單個(gè)細(xì)胞的瞬時(shí)分子圖譜，為重建動(dòng)態(tài)生物學(xué)過(guò)程提供了可能。在發(fā)育和疾病過(guò)程中，細(xì)胞命運(yùn)決定是由確定性調(diào)控事件和隨機(jī)性調(diào)控事件...
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anndata2ri | seurat與scanpy對(duì)象轉(zhuǎn)換的萬(wàn)能鑰匙單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析經(jīng)常需要在R與python之間切換，前面介紹過(guò)不少工具可以用來(lái)將seurat與scanpy對(duì)象互轉(zhuǎn)。雖然這些工具也可以轉(zhuǎn)換格式，但...
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你的打工龍蝦上線了么？最近這段時(shí)間“養(yǎng)龍蝦”很火，聽(tīng)說(shuō)龍蝦可以接管一切，可以幫忙干活，聊聊天就把活干了，這誰(shuí)能忍住不嘗試一下。不過(guò)，聽(tīng)說(shuō)好像龍蝦并不好安裝，對(duì)初學(xué)者并...
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腳本的關(guān)鍵詞應(yīng)該這么獲取有些帖子里面預(yù)留了腳本的獲取方式，在后臺(tái)回復(fù)對(duì)應(yīng)的關(guān)鍵詞即可獲取，而相應(yīng)的關(guān)鍵詞也在內(nèi)容里面，大部分讀者都可以得到關(guān)鍵詞，但還是有些粉絲不清楚，...
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