Mfuzz包最初是為了研究具有時(shí)間序列特征的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組數(shù)據(jù)中基因或蛋白表達(dá)的時(shí)間趨勢(shì)的一個(gè)工具包，它可以將基因按時(shí)間序列表達(dá)模式進(jìn)行聚類，可...
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R package：Mfuzz進(jìn)行基因表達(dá)的時(shí)間趨勢(shì)分析并劃分聚類群 -
利用 bioconda 管理生物信息軟件1 了解 conda，anaconda，miniconda，bioconda 1.1 conda conda是一個(gè)軟件模塊管理工具，也是一個(gè)可執(zhí)...
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【塊】生信上游-5 StringTiehighly efficient assembler of RNA-Seq alignments into potential transcri...
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更新go和kegg注釋
非模式物種 step1:注釋把本物種的蛋白序列用diamond到eggnog數(shù)據(jù)庫比對(duì) 拿到eggnog的注釋結(jié)果記得吧以#開頭的行全部刪掉st...
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關(guān)于如何用二代測(cè)序數(shù)據(jù)注釋單細(xì)胞細(xì)胞群起因是因?yàn)榭吹搅嗽蠋煹囊黄莆?https://mp.weixin.qq.com/s/S5TJ2JDOYAOynhjXwTH-FQ[https...
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生信步驟|轉(zhuǎn)錄組測(cè)序上游分析：hisat2+samtools+stringtie
轉(zhuǎn)錄組分析在當(dāng)下研究功能基因組領(lǐng)域十分常用。相關(guān)軟件組合種類也十分豐富，本文采用了hisat2+samtools+stringtie策略從轉(zhuǎn)錄組...
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pacbio 三代全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程Iso-seq基礎(chǔ)概念，轉(zhuǎn)載自https://blog.csdn.net/weixin_34384681/article/details/859...
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2022-06-14eggNOG注釋及cluster Profiler富集eggNOG網(wǎng)站注釋蛋白序列得到文件query_seqs.fa.emapper.annotations python環(huán)境 #git clone ...
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WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹 我在生信技能樹多次寫教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié)，見： 一文看懂WGCNA...
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（六）：GO、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略本節(jié)概覽：1.獲取DEG結(jié)果的上下調(diào)差異基因2.bitr()函數(shù)轉(zhuǎn)化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進(jìn)行KEGG...
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