歸納幾篇eQTL相關(guān)文章。 1.轉(zhuǎn)自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL...
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復(fù)現(xiàn)：純R代碼實現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度最近學(xué)習(xí)了生信菜鳥團的純R代碼實現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度,想復(fù)制作者的流程，但是發(fā)現(xiàn)了幾個不一樣的地方，所以重新整理流程，代碼主要...
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R語言circos繪制介紹 circos可以作為數(shù)據(jù)展示的一種手段，主要用于基因組數(shù)據(jù)的可視化，比如甲基化，組蛋白修飾，snp，indel，sv，以及常見的基因表達(dá)水...
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轉(zhuǎn)錄組分析——如何尋找差異基因中的中樞基因（hubgene）一、前言 好久沒更新過文章啦，今天我們來聊一聊怎么找hubgene。 二、常見的尋找hubgene方法 我們?nèi)绻芯恳粋€疾病，通常會做一個疾病...
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HaplotypeCaller是怎么計算PL的？（VCF解密）寫在前面 PL是HaplotypeCaller等GATK變異檢測軟件在sample層面給出的注釋，一般記錄在VCF文件的FORMAT/sampl...
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學(xué)生信的那些事兒之十六 - 生信技能樹VCF格式文件的shell小練習(xí)
開始做題前需要生成vcf文件先： 想要順利的把題目做完，基礎(chǔ)的Linux命令當(dāng)然需要熟練運用，更關(guān)鍵的是對 vcf 文件格式和內(nèi)容的了解。 把突...
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表觀遺傳學(xué)-DNA甲基化一、DNA的甲基化 DNA甲基化 ①1、 在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶（DNA methyltransferase, DNMTs）的作用下，將一個甲基添加...
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甲基化概念及功能簡述甲基化概念及功能簡述 一、表觀遺傳學(xué) 真核生物基因表達(dá)受多種機制、多層面的綜合調(diào)控?；虻腄NA序列不發(fā)生改變的情況下，基因的表達(dá)水平與功能發(fā)生...
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「文獻01」ATAC-pipe: ATAC-seq分析的工具包日期：2019年1月6日——2019-Week1分類：「工具」題目：ATAC-pipe: general analysis of genome-...
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gganatogram 人體解剖醫(yī)學(xué)包原文來源 https://jespermaag.github.io/blog/2018/gganatogram/本文為翻譯版，不當(dāng)之處請見諒！ ...
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