IP屬地：內(nèi)蒙古自治區(qū)
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snakemake 轉(zhuǎn)錄組上游pipeline
trim-galore + hisat2 + featureCounts
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10x單細胞數(shù)據(jù)上游分析
1. 下載cellranger, 這里下載的是6.0最新版本 2. 下載cellranger專用的參考基因組, 10x官網(wǎng)提供了小鼠和人的參考基...
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項目部署 nginx + uwsgi + flask/django 踩坑記錄一下在騰訊云上部署項目nginx + uwsgi + python-flask/django 軟件版本 python 3.6 flask l...
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plotly for R簡介 交互式繪圖工具, 提供python, R, js接口, 以R接口為例 api類似, 需要注意在參數(shù)中涉及子項的在R中使用列表, 在pyth...
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git 常用指令
GIT GIT簡介 什么是git: git是一個開源到分布式版本控制系統(tǒng), 用于高效的管理各種大小項目和文件 代碼管理工具的用途 防止代碼丟失,...
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linux常用指令
grep 按照文件中指定pattern的行，語法： 常見選項： 舉例： cut cut是列的截取工具，語法： 常見選項： 舉例： sort so...
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R語言學(xué)習(xí)筆記_06
方差分析 以焦慮癥治療為例，現(xiàn)有兩種治療方案：認知行為療法（CBT）和眼動脫敏再加工法（EMDR）。我們招募10位焦慮癥患者作為志愿者，隨機分配...
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ComplexHeatmap繪制復(fù)雜熱圖pheatmap交互 最近ComplexHeatmap更新可以將pheatmap對象進行參數(shù)轉(zhuǎn)換。新增的ComplexHeatmap::phea...
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GRanges
IRanges用于解決序列在基因組上的位置問題，GRanges在IRanges的基礎(chǔ)上增加了染色體和DNA鏈的信息。在GRanges內(nèi)部可以使用...