記錄一下在騰訊云上部署項目nginx + uwsgi + python-flask/django 軟件版本 python 3.6 flask lastest django 1...
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項目部署 nginx + uwsgi + flask/django 踩坑 -
RRBS Bismark methylKit0.質(zhì)控 1.建立亞硫酸鹽基因組index 2. 比對 輸出結(jié)果有兩個重要文件，一個bismark_bt2_PE_report.txt，一個bismark_bt2_pe.ba...
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GENIE3——一款預(yù)測基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的R包
在網(wǎng)上隨意瀏覽的時候，無意間發(fā)現(xiàn)另一種可以構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的軟件，叫做GENIE3。這是一個R包，直接在R里運行。這款R包基于你的表達矩陣來推測基因之間的調(diào)控關(guān)系。 雖然共表達網(wǎng)...
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【文獻解讀】-單細胞調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的推理和聚類（SCENIC）SCENIC是一種同時重建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)并從單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)中鑒定stable cell states的工具?；诠脖磉_和DNA?；?（motif）分析推斷基因調(diào)控網(wǎng)...
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2019-08-26用ggplot2畫“美圖”A ggplot2 Tutorial for Beautiful Plotting in R 原文見https://cedricscherer.netlify.com/201...
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還在用PyCharm寫Python，Visual Studio Code不香嗎？
眾所周知PyCharm是一個強大的編輯器，但是他的強大成為了他的弱點，占用運行內(nèi)存大，內(nèi)存經(jīng)常爆棚。而且還收費，PJ不穩(wěn)定。 不如來嘗試一下Visual Studio Cod...
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協(xié)方差分析一、為什么要使用“協(xié)方差分析”？ 在我們的研究過程中經(jīng)常會出現(xiàn)除了關(guān)注的自變量和因變量，還有一些其他的因素也會影響因變量，但我們又不想考慮他們，這個時候就需要借助協(xié)方差分析了...
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RNA-seq snakemake 自動化流程教程很多，隨便列兩個，強烈推薦學(xué)起來，沒有python基礎(chǔ)也可以搞定 參考1參考2Snakemake搭建生信分析流程-簡介snakemake使用筆記[轉(zhuǎn)]snakemake-...
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GSVA + limma進行差異通路分析
一般我們做GSEA都是先進行差異基因分析，然后取差異倍數(shù)排序結(jié)果進行GSEA。但如果你沒有條件進行差異基因分析也可以進行GSEA，這就是ssGSEA(single sampl...
