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現(xiàn)階段用的最多的是腫瘤患者預(yù)后模型的預(yù)測精度。 C-index,C指數(shù)即一致性指數(shù)(index of concordance),用來評價(jià)模型的預(yù)...
批量生存分析 使用 coxph 回歸方法 批量生存分析 使用 logrank test 方法 參考來源:生信技能樹 友情鏈接: 課程分享生信技...
GEO再學(xué)習(xí) GEO數(shù)據(jù)挖掘已經(jīng)成為生信學(xué)者必備技能,我以為自己會跑代碼了就是會了,其實(shí)呢,細(xì)細(xì)去領(lǐng)會每個(gè)細(xì)節(jié),還是會發(fā)現(xiàn)很多盲區(qū).聽了曉娟老師...
生存分析中的ROC是怎么來的,ROC是對二分類資料的評價(jià)指標(biāo),那對于生存資料呢? 首先我們分析生存資料的特點(diǎn):(1)包含有結(jié)局和時(shí)間兩個(gè)方面的信...
2018年腫瘤免都疫榮獲諾獎,成為一大熱點(diǎn)。咱有些小伙伴的數(shù)據(jù)庫挖掘卻一萬年停留在那些被玩壞了的套路上,比如像這樣做一個(gè)GEO的差異分析,就放上...
一 . 從GEO數(shù)據(jù)庫中下載表達(dá)矩陣文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_mat...
DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart) DESeq2對于輸入數(shù)據(jù)的要求1.DEseq2要求輸入數(shù)據(jù)是由整數(shù)組成的矩陣。2.DESe...
TCGA-101-課程介紹-需要哪些背景知識 基于TCGA28篇教程 掌握以下基礎(chǔ)知識: 概念、研究范圍、數(shù)據(jù)來源、數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)格式、癌癥相關(guān)...
Application of weighted gene co-expression network analysis to identify ...