寫在前面 為什么 TBtools 用起來舒服，相比于不少其他軟件，同質(zhì)非同質(zhì)的？我想了很久，可能原因之一，即“開發(fā)者即用戶本身”，簡單來說，“我...
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可視化！Circos 圖繪制，更簡單更靈活更方便~ -
零基礎(chǔ)使用TBtools -go kegg 功能富集分析方法總結(jié)超詳細-2023零基礎(chǔ)使用TBtools -go kegg 功能富集分析方法總結(jié)超詳細-2023 1. 使用eggNOG-mapper 網(wǎng)站 ，對物種所有的蛋白...
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點陣圖 | 比較基因組分析之基石 - 手把手入門教程寫在前面 前述，我們通過《安裝 | 比較基因組系列之一 - WGDI 軟件安裝與配置》一文，帶大伙安裝和配置了我們 WGDI 軟件。接下來，我們...
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基因在染色體上位置可視化感謝CJ大神的反復(fù)修改，這個功能越變越好了！本文旨在復(fù)現(xiàn)CJ大神推文內(nèi)容，具體請參考“省心炸雞”，手動狗頭（https://www.jiansh...
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一. 染色體不同區(qū)域基因表達水平可視化（bwa, samtools, bedtools, TBtools ）1. bwa index ref.fa; eg: $ bwa index Genome.fas; 2. bwa mem ref.fa read1...
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稀有 | GXF Stat 一次統(tǒng)計物種的Gene/mRNA/Exon/Intron/CDS/UTR...信息寫在前面 近日在鼓搗課題的過程中，遇到了一些數(shù)據(jù)整理需求。需要快速統(tǒng)計物種的序列特征情況，比如基因，轉(zhuǎn)錄本，外顯子，內(nèi)含子，CDS，UTR等。但...
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QTLseq數(shù)據(jù)分析，鼠標點點，復(fù)現(xiàn) Nature Plant 番茄論文結(jié)果寫在前面 快一年了，寫了重測序三兄弟插件，幾乎所有用戶都可以用 TBtools 輕松完成 BSAseq 數(shù)據(jù)分析。當然，我自己基本也沒怎么折騰過...
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基因家族分析十（基因家族加倍分析）一：數(shù)據(jù)準備 自己去下載擬南芥的基因組，gff3，CDS序列，pep文件。 1.根據(jù)gff文件獲得基因位置信息。 可以自己用awk抓，也可以寫個...
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物種內(nèi)共線性圈圖繪制，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了！整天有人問，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義？你想說談什么生物學(xué)故事？ 承認...
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InterProScan 最強基因功能注釋軟件 - 最簡流程代碼參考官方文檔，目前 Interproscan 本地版幾乎免安裝，自帶數(shù)據(jù)庫，使用簡單。 下載與安裝 跳轉(zhuǎn)到軟件放置目錄 注意到軟件依賴 Java...
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