相關(guān)性分析用于評估兩個或多個變量之間的關(guān)聯(lián)性。 1. 兩個變量的相關(guān)性分析 參數(shù)相關(guān)性檢驗( parametric correlation ) ...
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R - 相關(guān)性分析 -
RNAseq轉(zhuǎn)錄組分析流程：fastp+hisat2+samtools+featureCounts+DESeq2
使用工具 fastp(質(zhì)控), hisat2(比對), samtools(sam文件轉(zhuǎn)bam文件), featureCounts(count計數(shù)...
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R繪圖|韋恩圖的常見繪制方法
實驗設(shè)計：對照組，TNF處理組，TGF處理組，IL4處理組，每組3個生物學(xué)重復(fù)實驗分組：TNF組 vs 對照組；TGF組 vs 對照組；IL4組...
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點陣圖 | 比較基因組分析之基石 - 手把手入門教程寫在前面 前述，我們通過《安裝 | 比較基因組系列之一 - WGDI 軟件安裝與配置》一文，帶大伙安裝和配置了我們 WGDI 軟件。接下來，我們...
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時，都是在公司做測序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個差異分析，得出像下圖那么完美...
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生信人的linux考試一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列 二、在創(chuàng)建好的文件夾下面，比如我的是 /Users/jimm...
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BLAST本地比對太慢，不怕用diamond
在宏基因組學(xué)研究中，又或者你準備做大規(guī)模的系統(tǒng)進化的相關(guān)研究等等，需要分析了數(shù)百萬個序列的reads，以確定來自環(huán)境的微生物樣品的功能或分類學(xué)含...
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忍受不了Blast比對的??速怎么辦？劉小澤寫于19.2.27將序列比對到nt、nr、uniprot、pfam等數(shù)據(jù)庫是常有的事，blast無疑是最常用的比對軟件，但是它的速度一直提...
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