1.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 用10x數(shù)據(jù)做scVelo，輸入數(shù)據(jù)分2部分: Seurat 分析后的數(shù)據(jù): 聚類、基因、細(xì)胞信息。 velocyto run 輸...
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scVelo 的使用: 從bam和Seurat獲取輸入數(shù)據(jù)到畫圖
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(Vim) 復(fù)合命令、重復(fù)、回撤
一鍵雙雕——復(fù)合命令 很多Vim的單鍵命令都可以被看成兩個或多個其他命令的組合。下面是類似的一些例子，它們有什么共同點(diǎn)呢？ 當(dāng)我們輸入ko命令時...
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ATAC-seq基礎(chǔ)知識（資源整理）ATAC-seq全名Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughpu...
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samtools-faidx用法
faidx： samtools faidxxxx.fa 能夠?qū)asta 序列建立一個后綴為.fai 的文件 該命令對輸入的fasta序列有一定...
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R數(shù)據(jù)可視化9:棒棒糖圖 Lollipop Chart棒棒糖圖，“望文生義”，就是長得像棒棒糖的圖。聽起來就很可愛是不是？今天就讓我們一起欣賞一下棒棒糖圖。 什么是棒棒糖圖 首先讓我們來看幾張棒棒糖...
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Dapars尋找APA1.下載ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主頁：https://g...
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celaref ||單細(xì)胞細(xì)胞類型定義工具Sarah Williams (2019). celaref: Single-cell RNAseq cell cluster labellin...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-16-用Scater包分析文章數(shù)據(jù)
劉小澤寫于19.8.20-第三單元第九講：使用Scater包筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)...
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富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時看看它們的功能，需要做個富集分析。雖然公司買了最新版的數(shù)據(jù)庫，如KEGG，但在集群跑下來嫌麻煩。這時網(wǎng)頁...
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生信學(xué)習(xí)基礎(chǔ)_R語言06_Matching reordering匹配與排序
原文地址：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/06_matching_reorde...
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