前面一個(gè)帖子主要介紹了PlantPhoneDB怎么做的和做了啥，今天這個(gè)帖子主要分享相關(guān)R包的使用和測試情況。 ====安裝==== 首先需要安...
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【細(xì)胞通訊】PlantPhoneDB（2） -
10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析方案大放送單細(xì)胞測序技術(shù)日漸火爆，其相關(guān)文章也層出不窮。隨著越來越多相關(guān)研究的出現(xiàn)，也有更多的科研工作者對其產(chǎn)生了興趣。 單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用之初，其研究主...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組分析之細(xì)胞的空間連接性作者，追風(fēng)少年i~~ 今天是美好的一天，但是生活總是在欺騙我，如果可以選擇，我選擇躺平，也不知道為什么，寫文章的時(shí)候能讓我獲得短暫的快樂~~~ ...
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零代碼在線繪制GO富集結(jié)果GOcircle圖什么是基因本體論（GO）？ 基因本體論（Gene Ontology，GO，http://www.geneontology.org/）是國際基因功...
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非模式物種GO富集數(shù)據(jù)庫準(zhǔn)備（一）當(dāng)我們需要做非模式物種的富集時(shí)，進(jìn)行查詢后也沒有對應(yīng)的數(shù)據(jù)，那么需要我們自己準(zhǔn)備。那就需要這個(gè)物種的基因組數(shù)據(jù)fasta 和gtf 文件自行構(gòu)建...
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NCBI ORFfinder結(jié)果在線可視化1，ORF簡介 開放閱讀框（Open Reading Frame，ORF）從起始密碼子開始，到終止密碼子結(jié)束的連續(xù)堿基序列，具有蛋白質(zhì)編碼潛能。...
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【報(bào)告筆記】作物順式調(diào)控模塊的挖掘與利用背景 調(diào)控基因的表達(dá)可實(shí)現(xiàn)植物表型和重要農(nóng)藝性狀的定向改變 ? SV影響基因表達(dá) （2020，Cell: Major Impacts of Wi...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）細(xì)胞通訊分析聯(lián)合大全作者，追風(fēng)少年i 周四了，一周最好的時(shí)光，不知道大家感覺怎么樣了？2022年上半年的最后一天，時(shí)光總是匆匆，不會(huì)為自己停留片刻。白哥有一句臺(tái)詞，...
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單細(xì)胞免疫組庫VDJ——基礎(chǔ)知識（一）一、什么是免疫組庫 免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是指在指定時(shí)間，某個(gè)體循環(huán)系統(tǒng)中所有功能的多樣性T細(xì)胞和B細(xì)胞的總和。在...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合CRISPR技術(shù)發(fā)現(xiàn)改變腫瘤微環(huán)境的基因----空間CRISPR基因組學(xué)hello，大家好，今天周日，太原出現(xiàn)了新的疫情，再次被封，父母也都在家，介紹的好姑娘，見的機(jī)會(huì)也推遲了，那我們該怎么辦呢？？只好看看文獻(xiàn)，好好...
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