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相關性分析 | R語言 -- 兩個變量的相關性分析 -
生信＋實驗：最全單基因研究套路總結
隨著測序技術的發(fā)展，每年測序數(shù)據(jù)量以PB級增長。隨著海量測序數(shù)據(jù)的增長，越來越多的研究人員開始挖掘公共數(shù)據(jù)庫中的測序數(shù)據(jù)的意義。已有很多研究表明...
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免疫細胞豐度與基因表達量的相關性熱圖1.目的 要把免疫細胞與某些基因計算相關性，并畫出熱圖，例如（圖） 2.思路 其實就是把完整的相關性矩陣切出一部分，像這樣 只拿左上角或者右下角...
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單細胞筆記5-tSNE和UMAP降維 降維顧名思義就是把數(shù)據(jù)或特征的維數(shù)降低，一般分為線性降維和非線性降維，比較典型的如下： 線性降維：PCA(Principal Compon...
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常用分析的R代碼——配對樣本W(wǎng)ilcoxon符號秩檢驗（差值不服從正態(tài)）前言 專題目的：粗暴，簡單，直接套用 如果我們想知道成對測量值（均值）之間是否有差異，可考慮配對t檢驗。 本章配對樣本W(wǎng)ilcoxon符號秩檢驗...
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R語言初學筆記：差異表達基因
setwd("E:/GSE25066")#環(huán)境設置 library(limma)#加載差異分析包limma #將分組文件加載到環(huán)境中，分組信息第...
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WGCNA原理和分析流程WGCNA全稱weighted gene co-expression network analysis，即加權基因共表達網(wǎng)絡分析。它是一種分析多...
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2022-04-17GSEA縮寫 GSEA的全稱是Gene Set Enrichment Analysis, 中文翻譯就是基因富集分析，最早提出GSEA的文章是下面...
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R語言雜談（五）---處理數(shù)據(jù)框
## 如何了解一個數(shù)據(jù)框 ## 看頭 head(exprSet) ##前6行 head(exprSet)[,1:5] ##選取1-5列 ## 看...
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單細胞轉錄組學習筆記-4-獲取Github代碼包以及準備工作劉小澤寫于19.6.14-15-第二單元第二、三講：獲取Github代碼包以及準備工作 筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細胞轉錄組課程探索smart...
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