前言 銜接上一篇數(shù)據比對后的結果，使用R包DSS進行處理。 Input文件準備 我們先來復習一下上一節(jié)課得到的數(shù)據結果：*.bismark.co...
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DNA甲基化測序數(shù)據處理（二）：差異分析 -
450k甲基化基礎（一）基本概念 1. 什么是DNA甲基化 DNA甲基化是表觀遺傳學的中最為常見的一種修飾，其主要形式包括：5-甲基胞嘧啶 (5-mC)、少量的N6-甲...
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DNA甲基化測序數(shù)據處理（一）：數(shù)據比對前言 因為組里面出了一批甲基化測序數(shù)據，使用的技術為BS-seq，處理的時候順帶記錄了學習過程，演示使用數(shù)據為官方提供的example.fast...
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CUT&Tag數(shù)據分析筆記（1）前幾天學習了文獻CUT&Tag[http://www.itdecent.cn/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟著官網來學...
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CUT&Tag數(shù)據分析筆記（3）這是CUT&Tag數(shù)據分析的最后一部分，這一部分基本就是進行各種的可視化了。 第七節(jié) 可視化 通常，我們感興趣的是使用基因組瀏覽器在各個區(qū)域可視...
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CUT&Tag數(shù)據分析筆記（2）在開始筆記之前我只想吐槽一下，官網里這一部分的代碼錯的離譜?。?！各種報錯報的我懷疑人生。。。 第四節(jié) 比對結果過濾和文件格式轉換 （一）利用比對...
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ATAC-seq分析實操生信技能樹健明教程放在最前面的參考鏈接：給學徒的ATAC-seq數(shù)據實戰(zhàn)（附上收費視頻) 數(shù)據來源的文章： The landscape of accessible...
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ATAC-Seq 數(shù)據分析（上）背景： 染色質和染色體的結構和功能 每一條染色單體由單個線性DNA分子組成。細胞核中的DNA是經過高度有序的包裝，否則就是一團亂麻，不利于DNA...
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生信 | ATAC-Seq基礎分析+高級分析+多組學分析寫在前面 其實很多作者已經探索的差不多了，相關腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結一下吧。有時候感覺是浪費時間，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學習到...
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【張勇】ChIP-seq 講習班參考： 本講 PPT 下載鏈接為：http://pan.baidu.com/s/1skJAaAx，密碼：ga2l視頻鏈接：https://mp....
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