在上一篇文章中，分享了有關基因組Phasing的原理，一共有三種，分別是：家系關系分型(Related individuals Phasing)...
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如何使用Shapeit2對人類基因組數(shù)據(jù)進行Phasing -
【測序?qū)嶒灐慷鷾y序文庫讀長的影響因素-實驗角度簡介二代測序文庫讀長的影響因素-實驗角度簡介 一、現(xiàn)市場上，常見的文庫長度種類1)life的Ion Torrent平臺：該平臺主要用于臨床快速檢測、...
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建庫測序若干問題（2）測序錯誤率
轉自 https://yangguang8112.github.io/2017/03/09/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E9%94%9...
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建庫測序中的若干問題（1）轉自 http://www.biodiscover.com/news/research/732481.html 文庫結構可分為以下幾個部分：插入...
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測序中加入Phix的作用
轉自http://www.zxzyl.com/archives/789 測序中加入Phix的作用 測序建庫的時候，會加入一定比例的Phix，那么...
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人類基因組的Phasing原理是什么？什么是Phasing？ Phasing，或者說Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、單倍體分型、單倍體構建等在...
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樣本量重要，還是測序深度重要? 生物信息工程師可以分為多少種類型? |《解螺旋技術交流圈》精華第3期今天，繼續(xù)把發(fā)在“解螺旋技術交流圈”的部分主題整理出來，分享給你。 1. 請問對于同一份BAM文件使用samtools depth和用samto...
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GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實踐,我以這篇文章為標志,終結當前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗，稍作...
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人參考基因組不同版本區(qū)別 CRCH37 vs b37 vs hg19 vs hsd537 vs GRCH38
NCBI對應UCSC，對應ENSEMBL數(shù)據(jù)庫：GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52.GRCh37 (hg19):...
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從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第2節(jié) FASTA和FASTQ在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中，我們會接觸到許多生物信息學/基因組學領域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
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