在上一篇文章中，分享了有關(guān)基因組Phasing的原理，一共有三種，分別是：家系關(guān)系分型(Related individuals Phasing)...
投稿
收錄了13篇文章 · 44人關(guān)注
-
如何使用Shapeit2對人類基因組數(shù)據(jù)進行Phasing -
【測序?qū)嶒灐慷鷾y序文庫讀長的影響因素-實驗角度簡介二代測序文庫讀長的影響因素-實驗角度簡介 一、現(xiàn)市場上，常見的文庫長度種類1)life的Ion Torrent平臺：該平臺主要用于臨床快速檢測、...
-
建庫測序若干問題（2）測序錯誤率
轉(zhuǎn)自 https://yangguang8112.github.io/2017/03/09/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E9%94%9...
-
建庫測序中的若干問題（1）轉(zhuǎn)自 http://www.biodiscover.com/news/research/732481.html 文庫結(jié)構(gòu)可分為以下幾個部分：插入...
-
測序中加入Phix的作用
轉(zhuǎn)自http://www.zxzyl.com/archives/789 測序中加入Phix的作用 測序建庫的時候，會加入一定比例的Phix，那么...
-
人類基因組的Phasing原理是什么？什么是Phasing？ Phasing，或者說Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、單倍體分型、單倍體構(gòu)建等在...
-
樣本量重要，還是測序深度重要? 生物信息工程師可以分為多少種類型? |《解螺旋技術(shù)交流圈》精華第3期今天，繼續(xù)把發(fā)在“解螺旋技術(shù)交流圈”的部分主題整理出來，分享給你。 1. 請問對于同一份BAM文件使用samtools depth和用samto...
-
GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實踐,我以這篇文章為標志,終結(jié)當前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗，稍作...
-
人參考基因組不同版本區(qū)別 CRCH37 vs b37 vs hg19 vs hsd537 vs GRCH38
NCBI對應(yīng)UCSC，對應(yīng)ENSEMBL數(shù)據(jù)庫：GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52.GRCh37 (hg19):...
-
從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第2節(jié) FASTA和FASTQ在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中，我們會接觸到許多生物信息學/基因組學領(lǐng)域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1697539/crop1545101377398.jpg', '推薦專題《NGS測序分析》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/7d6cf8af484e?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}