這個(gè)是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據(jù)： 1）統(tǒng)計(jì)reads_1.fq 文件中共有多少條序...
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fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)
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sam和bam格式文件的shell小練習(xí)首先使用bowtie2軟件自帶的測試數(shù)據(jù)生成sam/bam文件，代碼如下： LINUX練習(xí)題 統(tǒng)計(jì)共多少條reads（pair-end read...
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VCF格式文件的shell小練習(xí)首先使用bowtie2軟件自帶的測試數(shù)據(jù)生成sam/bam文件，還有vcf文件代碼如下： LINUX練習(xí)題 把突變記錄的vcf文件區(qū)分成 IND...
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生信技能樹--Jimmy - Linux 20題一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列。 二、在創(chuàng)建好的文件夾下面，比如我的是 /Users/jim...
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生信人的linux考試一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列 二、在創(chuàng)建好的文件夾下面，比如我的是 /Users/jimm...
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Linux學(xué)習(xí)總結(jié)
1. 為什么要學(xué)習(xí)使用Linux系統(tǒng)？ 官方解釋：Linux優(yōu)點(diǎn)：1.批量；2.高效；3.多用戶實(shí)際解釋：90%生物信息學(xué)軟件均在Linux上運(yùn)...
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生信隨手記2020-03-18：shell腳本展示fastp修剪結(jié)果從修剪前后的fastq文件中各取100000行，將fastq格式文件每個(gè)序列的4行合并為1行，分別保存為raw.txt和filter.txt 從...
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生信軟件安裝記錄
bowtie2 bcftools
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【生信技能樹】VCF格式文件的shell小練習(xí)首先友情宣傳生信技能樹 全國巡講:R基礎(chǔ)，Linux基礎(chǔ)和RNA-seq實(shí)戰(zhàn)演練 : 預(yù)告：12月28-30長沙站 廣州珠江新城GEO數(shù)據(jù)挖掘滾...
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【生信技能樹】fa和fq格式文件的shell小練習(xí)【生信技能樹】fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)這個(gè)是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿...
專題公告
歡迎大家分享自己在完成生信技能樹linux作業(yè)時(shí)的筆記心得 。
生信人的 linux 20題 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html
處理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（約定成俗，大牛推廣）**的數(shù)據(jù)
fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3575.html
sam和bam格式文件的shell小練習(xí) http:...
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