筆記主要內(nèi)容：1~3代測序技術(shù)，fastq文件 & FASTQC （1）測序技術(shù) 1、一代測序技術(shù)：Sanger Sequencing 測序條件...
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【哈佛大學(xué)：計(jì)算生物學(xué) & 生物信息學(xué)】學(xué)習(xí)記錄（二） -
perl腳本練習(xí)：fasta格式與tab格式序列之間相互轉(zhuǎn)換(2)(適用范圍更廣)
前言 我的認(rèn)知里，fasta格式中“>”只會位于行首。但是我寫腳本用的示例數(shù)據(jù)里出兩行特殊id。這兩個(gè)id中除了行首的“>”，中間還有“>”，造...
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gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——NBISweden / AGAT在上一篇文章中，介紹了利用gffread進(jìn)行g(shù)ff和gtf的格式轉(zhuǎn)換，但是會丟失一些信息，比如UTR，因此這篇文章將介紹另一種方法，AGAT。g...
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單行命令利用plink進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理（修剪SNP集） ?。?！注意：如果要同時(shí)使用，正確做法是先SNP（geno）后樣本(mind)SNP缺失率多少用不了...
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你真的知道如何下載生物信息學(xué)公眾數(shù)據(jù)嗎
隨著測序技術(shù)的發(fā)展，每天都會有不少的測試數(shù)據(jù)上傳到NCBI SRA等的數(shù)據(jù)庫上，但是如果快速穩(wěn)定的下載上傳好的數(shù)據(jù)其實(shí)也是一門學(xué)問，今天就給大家...
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Linux2_ 文件和目錄操作4 文件和目錄操作 4.1 查看： tree 需要安裝下面是文件或目錄顏色代表的不同類型 ls ls -a 所有文件 前面帶.的代表是隱藏的...
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ubuntu首次登陸設(shè)置root密碼
給root用戶設(shè)置密碼 打開終端，輸入命令sudo passwd，輸入當(dāng)前用戶的密碼，然后系統(tǒng)會提示輸入新密碼Enter new UNIX pa...
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Linux常用命令
1基礎(chǔ)命令: cd -, cd .. , history, !5 , /home/ , /tmp/ , >,&，jobs,nohup 1,2,...
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Linux14_grep命令
1 grep用法 2 grep參數(shù) 選項(xiàng)描述:-i 忽略大小寫。不會區(qū)分大小寫字符。也可用--ignore-case 來指定。-v 不匹...
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Linux3_文本操作命令
5.1 wc wc命令計(jì)算文件的行數(shù)，字?jǐn)?shù)和字節(jié)數(shù)用法 -c 只顯示bytes數(shù)-l 只顯示行數(shù)-w 只顯示字?jǐn)?shù) 5.2 diff diff命令...
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