筆記主要內(nèi)容:1~3代測序技術(shù),fastq文件 & FASTQC (1)測序技術(shù) 1、一代測序技術(shù):Sanger Sequencing 測序條件...
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筆記主要內(nèi)容:1~3代測序技術(shù),fastq文件 & FASTQC (1)測序技術(shù) 1、一代測序技術(shù):Sanger Sequencing 測序條件...
前言 我的認(rèn)知里,fasta格式中“>”只會位于行首。但是我寫腳本用的示例數(shù)據(jù)里出兩行特殊id。這兩個(gè)id中除了行首的“>”,中間還有“>”,造...
在上一篇文章中,介紹了利用gffread進(jìn)行g(shù)ff和gtf的格式轉(zhuǎn)換,但是會丟失一些信息,比如UTR,因此這篇文章將介紹另一種方法,AGAT。g...
利用plink進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理(修剪SNP集) ?。?!注意:如果要同時(shí)使用,正確做法是先SNP(geno)后樣本(mind)SNP缺失率多少用不了...
隨著測序技術(shù)的發(fā)展,每天都會有不少的測試數(shù)據(jù)上傳到NCBI SRA等的數(shù)據(jù)庫上,但是如果快速穩(wěn)定的下載上傳好的數(shù)據(jù)其實(shí)也是一門學(xué)問,今天就給大家...
4 文件和目錄操作 4.1 查看: tree 需要安裝下面是文件或目錄顏色代表的不同類型 ls ls -a 所有文件 前面帶.的代表是隱藏的...
給root用戶設(shè)置密碼 打開終端,輸入命令sudo passwd,輸入當(dāng)前用戶的密碼,然后系統(tǒng)會提示輸入新密碼Enter new UNIX pa...
1基礎(chǔ)命令: cd -, cd .. , history, !5 , /home/ , /tmp/ , >,&,jobs,nohup 1,2,...
1 grep用法 2 grep參數(shù) 選項(xiàng)描述:-i 忽略大小寫。不會區(qū)分大小寫字符。也可用--ignore-case 來指定。-v 不匹...
5.1 wc wc命令計(jì)算文件的行數(shù),字?jǐn)?shù)和字節(jié)數(shù)用法 -c 只顯示bytes數(shù)-l 只顯示行數(shù)-w 只顯示字?jǐn)?shù) 5.2 diff diff命令...