發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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QTL上位性分析：QTLNetwork2.0官網(wǎng)：http://ibi.zju.edu.cn/index.html/BCL/software/qtlnetwork/download.htm...
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QTL定位：MapQTL6MapQTL是一款用于分析二倍體物種實(shí)驗(yàn)群體中數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)的Windows計(jì)算機(jī)程序，對(duì)于用戶比較友好，更加便于使用。通過(guò)QTL分析，...
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QTL定位：Rqtl2輸入文件
Rqtl2是Rqtl的加強(qiáng)更新版，可以更好地處理高維數(shù)據(jù)和復(fù)雜的群體設(shè)計(jì)，對(duì)于圖形輸出也有了較強(qiáng)的改善。 0.功能概述 Rqtl2所有功能的簡(jiǎn)單...
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冗余分析（RDA）——R包vegan從概念上講，冗余分析（redundancy analysis, RDA）是響應(yīng)變量矩陣與解釋變量矩陣之間多元多重線性回歸的擬合值矩陣的PCA分析...
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潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強(qiáng)人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往...
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ggplot2繪制棒棒糖圖——Lollipop chart棒棒糖圖，就是長(zhǎng)得像棒棒糖一樣的圖（一句廢話），和柱形圖，散點(diǎn)圖想要表達(dá)的意思是一致的，不過(guò)展示會(huì)更加好看一點(diǎn)，是點(diǎn)圖geom_point()和...
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vcf文件提取SNP位點(diǎn)
測(cè)序得到VCF文件后，有時(shí)需要提取部分SNP位點(diǎn)，這里介紹的工具是VCFtools，安裝以及基礎(chǔ)功能見(jiàn)下貼：vcftools安裝及基礎(chǔ)用法 - ...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完，從背景到code、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來(lái)也有二十余篇，按分析的流程整理出一...
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UPGMA法聚類分析——NTsys2.10eNTsys是一款強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)分析軟件，具有多個(gè)統(tǒng)計(jì)模型組件，在植物多樣性分析中經(jīng)常會(huì)用到。其中最主要的模塊是聚類分析，常用的方法有UPGMA、CL...