GS-MM散點(diǎn)圖用于篩選hub gene,但是之前的圖實(shí)在是有點(diǎn)丑,放在文章里好像有點(diǎn)拉胯,所以準(zhǔn)備重新繪制。前期過程在專題(3)中已經(jīng)介紹過了...
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GS-MM散點(diǎn)圖用于篩選hub gene,但是之前的圖實(shí)在是有點(diǎn)丑,放在文章里好像有點(diǎn)拉胯,所以準(zhǔn)備重新繪制。前期過程在專題(3)中已經(jīng)介紹過了...
通過前期的分析,我們確定了感興趣的module,但是module中又含有幾十甚至上百的基因,下一步需要進(jìn)一步篩選hub gene。 WGCNA(...
這篇文章是WGCNA系列的最后一篇,其余見鏈接:WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[https://...
在前面的帖子中介紹了數(shù)據(jù)的導(dǎo)入和清洗,網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的兩種方法,模塊與性狀的關(guān)聯(lián),這篇文章將介紹如果進(jìn)行模塊可視化。WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)...
前面的文章中完成了數(shù)據(jù)導(dǎo)入和網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,下面是將基因模塊與性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián),從而識(shí)別與表型相關(guān)的重要基因。WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 -...
在前兩篇帖子中介紹了數(shù)據(jù)的導(dǎo)入清洗,以及一步法構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),這篇文章將介紹網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的第二種方法,分步法。WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 -...
在上一篇帖子上完成了表達(dá)量數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)的整理,這篇文章將進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和模塊檢測(cè)。 WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡(jiǎn)書 (jia...
WGCNA:加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,簡(jiǎn)而言之,就是將基因劃分為若干個(gè)模塊,探究與表型數(shù)據(jù)與基因模塊之間的相關(guān)關(guān)系,并找到模塊中的核心基因。 適用...