前言:Nanopore的超讀長測序能在短時間內(nèi)產(chǎn)生海量數(shù)據(jù),借助官方分析軟件Epi2Me,可以直接進行數(shù)據(jù)分析。但是Epi2Me是云端計算的,所...
投稿
前言:Nanopore的超讀長測序能在短時間內(nèi)產(chǎn)生海量數(shù)據(jù),借助官方分析軟件Epi2Me,可以直接進行數(shù)據(jù)分析。但是Epi2Me是云端計算的,所...
Nanopore native RNA sequencing of a human poly(A) transcriptomeFLAIR原始文章...
利用二代測序比三代測序堿基質(zhì)量值更高的特點,對三代數(shù)據(jù)組裝結(jié)果進行polish。 但是不能簡單根據(jù)比對BAM文件來矯正。這里作者把 HiFI數(shù)據(jù)...
Nanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomobo Tombo is a suite of tools primarily for the identif...
今天我們介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本校正,聚類,可變剪切分析,定量和差異分析為一體的工具 - FLAIR[https://flair...
環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類特殊的非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),也是RNA領域最新的研...
個人認為隨著國內(nèi)第一批PacBio Kinnex full-length RNA測序數(shù)據(jù)的下機,以及Revio測序儀的加持,PacBio全長轉(zhuǎn)錄...
今天我們繼續(xù)介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本注釋和定量的工具 - Bambu[https://github.com/GoekeLab/b...
今天我們介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本注釋和定量的工具 - IsoQuant[https://www.nature.com/artic...
微生物研究新世代 -- 三代全長16S (Full-length 16S) 時至今日,微生物群落研究已全面進入測序分析階段,當前研究主流處于二代...