前言：Nanopore的超讀長測序能在短時間內(nèi)產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)，借助官方分析軟件Epi2Me，可以直接進行數(shù)據(jù)分析。但是Epi2Me是云端計算的，所...
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【軟件安裝】---Nanopore官方開源軟件Centrifuge安裝和使用 -
Nanopore可變剪切分析Nanopore native RNA sequencing of a human poly(A) transcriptomeFLAIR原始文章...
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NextPolish2：一種針對HiFi數(shù)據(jù)組裝的基因組堿基矯正算法利用二代測序比三代測序堿基質(zhì)量值更高的特點，對三代數(shù)據(jù)組裝結(jié)果進行polish。 但是不能簡單根據(jù)比對BAM文件來矯正。這里作者把 HiFI數(shù)據(jù)...
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Nanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomoboNanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomobo Tombo is a suite of tools primarily for the identif...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | 三代全長轉(zhuǎn)錄組分析流程（PacBio & ONT ）-- Flair今天我們介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本校正，聚類，可變剪切分析，定量和差異分析為一體的工具 - FLAIR[https://flair...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | 三代全長轉(zhuǎn)錄之circRNA（ONT ）-- CIRI-long環(huán)狀RNA（circular RNA，circRNA）是一類特殊的非編碼RNA（noncoding RNA，ncRNA），也是RNA領域最新的研...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | PacBio 全長轉(zhuǎn)錄組測序的時代是否已經(jīng)來了？ Kinnex full-length RNA Kit測評個人認為隨著國內(nèi)第一批PacBio Kinnex full-length RNA測序數(shù)據(jù)的下機，以及Revio測序儀的加持，PacBio全長轉(zhuǎn)錄...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | 三代全長轉(zhuǎn)錄組分析流程（PacBio & ONT ）-- Bambu今天我們繼續(xù)介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本注釋和定量的工具 - Bambu[https://github.com/GoekeLab/b...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | 三代全長轉(zhuǎn)錄組分析流程（PacBio & ONT ）-- IsoQuant今天我們介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)錄本注釋和定量的工具 - IsoQuant[https://www.nature.com/artic...
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微生物全長16S | Full-length 16S Analysis -- PacBio Hifi Reads微生物研究新世代 -- 三代全長16S （Full-length 16S） 時至今日，微生物群落研究已全面進入測序分析階段，當前研究主流處于二代...
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