背景介紹 verkko是一個最新的可以應(yīng)用于二倍體基因組T2T(telomere-to-telomere)級別的基因組組裝的組裝軟件。 2022...
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背景介紹 verkko是一個最新的可以應(yīng)用于二倍體基因組T2T(telomere-to-telomere)級別的基因組組裝的組裝軟件。 2022...
在組裝未知基因組時,往往需要利用重測序數(shù)據(jù)提前進(jìn)行基因組調(diào)查,以獲取其基因組規(guī)模,雜合率,重復(fù)序列比例,GC含量等信息。從而更好地擬定后繼測序策...
BUSCO的原理及安裝使用可參考:BUSCO - 組裝質(zhì)量評估 - 簡書 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
前言 最近分析葉綠體基因組,進(jìn)行SNP Calling,網(wǎng)上搜到生信藥丸[http://www.itdecent.cn/u/068665394...
微信收藏夾中的文獻(xiàn)解讀,只整理出今年2022年已收藏的部分文獻(xiàn),之前的太多,不列了。后續(xù)計劃每周更一次,自己會看得更認(rèn)真點,解讀更詳細(xì)些。 Na...
一、人類參考基因組的來源 1、人類基因組計劃 1)2001年草圖,繪制人類基因組圖譜 2、數(shù)據(jù)庫的名稱 1)UCSC:hg19,hg38 2)N...
Hortic Res | 中國醫(yī)科院藥植所盧善發(fā):藥用植物北馬兜鈴染色體水平的基因組圖譜[https://mp.weixin.qq.com/s/...
單細(xì)胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)...
我使用的maker版本為3.01.04 第一輪:將已知基因比對到基因組 包括兩個部分:??屏蔽重復(fù)序列??將已知的轉(zhuǎn)錄組/蛋白序列與基因組進(jìn)行比對 ...