基因流(也稱基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì),從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因,...
投稿
基因流(也稱基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì),從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因,...
前幾天,實(shí)驗(yàn)室的師弟師妹通過本地blast獲取一些沒有基因組注釋物種的蛋白編碼序列。原本以為可以快速地進(jìn)行下一步的選擇壓力分析,沒想到卻在多序列...
系統(tǒng)發(fā)育學(xué)概念 系統(tǒng)發(fā)生(或種系發(fā)生、系統(tǒng)發(fā)育,phylogeny)是指生物形成或進(jìn)化的歷史。系統(tǒng)發(fā)生學(xué)(phylogenetics)研究物種之...
如果根據(jù)SNP或者Indel 構(gòu)建其系統(tǒng)進(jìn)化樹,可以展示群體中不同個(gè)體的相互關(guān)系,基因變異相似的往往會在同一個(gè)樹的cluster中,一顆好的樹可...
很早之前就覺得用DNAMAN做的多重比對導(dǎo)出來的圖不是很好看了,而且后期還要進(jìn)行PS或者PPT進(jìn)行修飾。 因此,到網(wǎng)上去找了一些方法也做了一些嘗...
前言 : 隨著NGS(Next Generation Sequencing)技術(shù)日益成熟,如今一臺設(shè)備一天可產(chǎn)生100G的堿基匹配數(shù)據(jù)。其產(chǎn)生的...
BWA Burrows-Wheeler Aligner作為一個(gè)十分出名的alignment軟件,在各個(gè)生信領(lǐng)域的比對中都發(fā)揮了重要的作用。但是如...
這是一個(gè)非常老的軟件,距離他不更新至少有10多年了,但是目前還是有很多公司用他進(jìn)行基因組注釋,包括ENSEMBL的注釋流程的幾個(gè)核心部分用到的也...
全局比對 Global Alignment 由芝加哥的Needleman和Wunsch兩位于上個(gè)世紀(jì)70年代初提出,常被稱之為Needleman...
CD-hit 參數(shù)解讀 -i 設(shè)置輸入文件 -o 設(shè)置輸出文件,可以將每次分析的ID閾值放到名稱中,方便以后使用,如clean90,就是被清洗后...