之前有一次,我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”,因此,我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后,最終用ggpl...
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之前有一次,我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”,因此,我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后,最終用ggpl...
眾所周知,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)發(fā)現(xiàn)的很多變異位點(diǎn)基本為非編碼,這些變異位點(diǎn)1)要么調(diào)控基因表達(dá)(eQTL); 2)要么影響增強(qiáng)子活性; ...
LAI是一種新的評估基因組組裝質(zhì)量的評價標(biāo)準(zhǔn)。LTR講解[http://www.itdecent.cn/p/a93cdbc36339]部分轉(zhuǎn)載...
相見恨晚,還好遇到了它 今天用BLASTX將我的轉(zhuǎn)錄本序列在UniProt蛋白數(shù)據(jù)庫(700w條序列)中搜索,80個線程,過了1小時大概就分析1...
ExPASy是一個大型綜合性在線工具,用于生物信息學(xué)的在線工具合集。https://www.expasy.org/ 有上述圖標(biāo)的是 SIB維護(hù)的...
1.基因組綜合研究數(shù)據(jù)庫 數(shù)據(jù)庫植物網(wǎng)址TAIR擬南芥http://www.arabidopsis.org/[http://www.arabid...
ggplot2的首席專家Thomas Lin Pedersen發(fā)布了patchwork這個包,專業(yè)拼圖簡單好用。patchwork官方地址[ht...
0.關(guān)于snpEff,建議大家去官網(wǎng)[http://snpeff.sourceforge.net/index.html]看一下作者。逝者已去,深...
ggrepel參考[http://www.itdecent.cn/p/84e7e0e029cd]火山圖參考[https://www.jians...
常規(guī)的質(zhì)控和過濾數(shù)據(jù)是fastqc+trimmomatic,據(jù)說fastp更快,而且一次完成質(zhì)控過濾和出圖。fastp的githubfastp的...