乳腺上皮細(xì)胞(mammary epithelial cells,MECs)結(jié)構(gòu)特征以及發(fā)育過程中如何受到調(diào)控,對于理解乳腺癌發(fā)生至關(guān)重要。 本研...
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乳腺上皮細(xì)胞(mammary epithelial cells,MECs)結(jié)構(gòu)特征以及發(fā)育過程中如何受到調(diào)控,對于理解乳腺癌發(fā)生至關(guān)重要。 本研...
說明:僅根據(jù)官網(wǎng)指南加個人理解,相應(yīng)圖片參考官網(wǎng)(目前官網(wǎng)上最新的Tutorial已經(jīng)更新成Seurat3.0版本,下面的流程是2.4版本,有些...
該文章主要整理自珠穆拉瑪峰的文章《從拉普拉斯矩陣說到譜聚類》,添加了少部分個人理解的文字和公式推導(dǎo) 該文章同步發(fā)表于 github 和 gith...
該聚類方法名為SC3(Single-Cell Consensus Clustering) 該方法本質(zhì)上就是K-means聚類,不過在執(zhí)行K-me...
先說我的態(tài)度。 最快的捷徑就是沒有捷徑,踏踏實實搞學(xué)問 我一直相信慢工出細(xì)活(當(dāng)然我寫推文都不怎么想回頭檢查錯別字),要學(xué)習(xí)什么東西,穩(wěn)扎穩(wěn)打才...
scRNA-seq數(shù)據(jù)分析想必大家都比較熟悉了,自2014年nature biotechnology提出單細(xì)胞擬時分析或稱為軌跡分析(Traje...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序--閑言碎語 時代發(fā)展的步伐總是毫不留情的將你甩在身后,連車尾燈都看不見。當(dāng)你還在沉迷于普通轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘時,已經(jīng)有人悄悄的搞上...
上期我們講了使用Seurat分析單個樣本,那么2個或多個樣本的分析會有哪些不同呢?單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中一個重要的問題就在于批次效應(yīng),任何一個試驗步...
這周每天都起的很早,大概5:30就醒了,然后打開學(xué)習(xí)強(qiáng)國會看電影者紀(jì)錄片。看完了《感動中國·2018》、《家蠶育種專家向忠懷》、《大醫(yī)精誠·黃澄...
10x數(shù)據(jù)類型: 每個樣本測出3個fastq,通過I1,R1,R2來區(qū)別,下載安裝cellranger,下載所需要的reference, (一)...