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MSMC2進行歷史有效種群大小計算 -
跟著PNAS學作圖：R語言ggplot2作圖展示多序列比對結(jié)果論文 The evidence remains clear: SARS-CoV-2 emerged via the wildlife trade...
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跟著Nature Genetics學畫圖：R語言ggbio包畫基因結(jié)構(gòu)圖論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cu...
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群體遺傳 || Pophelper-群體結(jié)構(gòu)可視化學習
Pophelper基本說明 群體遺傳下游分析中的一項常規(guī)分析即是群體結(jié)構(gòu)的分層展示(STRUCTURE ANALYSIS)，不同于系統(tǒng)樹和PCA...
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群體遺傳中基于SNP的PCA分析
基于群體遺傳中變異信息文件VCF來分析PCA 第一種方法 可以使用plink軟件直接進行分析 plink --vcf all_genotypeg...
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生信分析|Minimap2+sniffles calling SVs
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignment program tha...
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Sniffles：長讀長數(shù)據(jù)SV檢測
Sniffles使用簡介 介紹: Sniffles用于檢測長讀長數(shù)據(jù)的SV。主要為Pacbio數(shù)據(jù)而設(shè)計，但對于Oxford Nanopo...
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神燈寶典之三代重測序分析實錄（二）
作者：云歌審稿：童蒙編輯：angelica 引言 以PacBio公司SMRT技術(shù)為代表的第三代單分子熒光測序平臺為以測序為基礎(chǔ)的科學研究帶來了革...
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植物泛三維基因組研究思路泛三維基因組是以Hi-C技術(shù)為核心，結(jié)合基因組及表觀功能組學研究技術(shù)，對細胞核內(nèi)的三維空間結(jié)構(gòu)與基因功能和結(jié)構(gòu)變異間的關(guān)系進行研究, 了解物種或...
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準備MCScanX運行及結(jié)果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便...
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