上一節(jié)數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||冗余分析（RDA）概述中，我們回顧了RDA的計(jì)算過(guò)程，不管這個(gè)過(guò)程我們有沒(méi)有理解透徹，我希望你能知道的是：RDA是響應(yīng)變...
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數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||冗余分析（RDA） -
RDA 結(jié)果解讀介紹 微生物多樣性分析中，α多樣性主要關(guān)注局域均勻生境下的物種數(shù)目 ，通俗來(lái)講就是樣本內(nèi)的物種多樣性。β多樣性是指在地區(qū)尺度上，物種組成沿著某個(gè)...
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核心菌群1.基本概念 核心菌群本身就是人為定義的，所以一方面看文獻(xiàn)，參考權(quán)威期刊上面發(fā)表的文章的界定，一方面也可以根據(jù)自己的數(shù)據(jù)調(diào)整閾值，因?yàn)椴煌h(huán)境界...
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R可視化——?dú)馇驁D????ggballoonplot（氣球圖）是一種用于多分類(lèi)數(shù)據(jù)展示的圖形，圖中每個(gè)單元格都包含一個(gè)點(diǎn)，其大小反映了相應(yīng)樣本的相對(duì)大小。如果我們...
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ggpubr 包是基于ggplot2包，非R數(shù)據(jù)專(zhuān)業(yè)人員可用ggpubr包繪制圖表本文參考ggpubr包官方文檔https://rpkgs.datanovia.com/ggpubr/index.html[https://rpk...
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生信常用分析圖形繪制02 -- 解鎖火山圖真諦！有了R語(yǔ)言的基礎(chǔ)，以及ggplot2繪圖基礎(chǔ)，我們的生信常用分析圖形的繪制就可以提上日程了！本系列，師兄就開(kāi)始帶著大家一起學(xué)習(xí)如何用R語(yǔ)言繪制我...
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生信常用分析圖形繪制01 -- 各種類(lèi)型的熱圖！有了R語(yǔ)言的基礎(chǔ)，以及ggplot2繪圖基礎(chǔ)，我們的生信常用分析圖形的繪制就可以提上日程了！本系列，師兄就開(kāi)始帶著大家一起學(xué)習(xí)如何用R語(yǔ)言繪制我...
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R語(yǔ)言ggplot2作圖好看的配色備選配色來(lái)源于論文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.n...
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跟著Nature Genetics學(xué)作圖：R語(yǔ)言ggplot2普通箱線圖/分組箱線圖/分面箱線圖論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ances...
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