NTsys是一款強大的統(tǒng)計分析軟件，具有多個統(tǒng)計模型組件，在植物多樣性分析中經(jīng)常會用到。其中最主要的模塊是聚類分析，常用的方法有UPGMA、CL...
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UPGMA法聚類分析——NTsys2.10e -
基因家族分析（5）繪制基因結(jié)構(gòu)圖本節(jié)介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server（GSDS），簡單好用功能強大。將基因家族成員 gf...
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植物耐冷調(diào)控機制的研究進展
低溫是主要的嚴重影響植物生長和發(fā)育的環(huán)境因子，并且會影響作物的產(chǎn)量。植物演化出了一系列的機制，使它們能夠在生理和分子水平適應低溫脅迫。在過去的二...
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快速 | 蛋白序列兩兩相似度矩陣計算寫在前面 Emmm，有時候，我們可能通過一些比對軟件，如 BLAST , DIAMON 或者 ghostz 得到一堆序列比對結(jié)果。當然，我們也可...
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蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預測、結(jié)果解讀與評分蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預測，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物種，沒有太多要求，可為文章增色。windows版本的VMD軟件可在公眾號生信星球回...
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如何在NCBI批量下載基因家族序列？在做生信下游基因分析的時候，我們通常需要下載興趣基因的序列信息構(gòu)建進化書什么的，如果興趣基因比較少，那么可以直接在NCBI上搜索這個基因下載序列...
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TBtools | 多圖合一至強版教程！進化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個功能可以說...
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如何利用NCBI預測基因的結(jié)構(gòu)域和保守位點1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中。具體我們可以進入NCBI后選擇Con...
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如何從Genebank.gbk文件中提取faa（蛋白質(zhì)）、fna（DNA）序列今天遇到了這個問題，但是搜索了好久也沒找到真正的解決辦法。后來找到了這個網(wǎng)站，按照里面提供的方法解決了。看到其他小伙伴也有同樣困惑。我把網(wǎng)址貼出...
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如何使用SPDE進行共線性分析（MCScanX）在進行共線性分析的時候需要準備兩個文件：一個是blast文件，一個是gff文件。這兩個文件都是需要經(jīng)過相應處理的。在這里還是稍微跟同學們說一下原...
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