首先附上軟件鏈接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemP...
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處理NGS的新神器systemPipeR -
ChIP-seq分析的一般流程方法現(xiàn)在ChIP-seq的數(shù)據(jù)基本是最常見的測序數(shù)據(jù)類型之一，主要有Transcription factor ChIP-seq和Histone Ch...
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嫌picard去重復(fù)太慢？快來試試這兩個高效快速的工具吧~SAMBAMBA http://lomereiter.github.io/sambamba/ 一、安裝 (支持mac OS/linux 64位)...
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析（一）：從raw reads到peaks開篇致謝：下面內(nèi)容的整個框架是跟著生信技能樹發(fā)布在bilibili上的ChIP-seq視頻學(xué)習(xí)的，鏈接：https://www.bilibili...
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ATAC-seq 分析（上）之前寫過ChIP-seq的基礎(chǔ)分析：ChIP-seq數(shù)據(jù)分析（一）：從raw reads到peaks，和此文有很多相似之處。 簡介 ATAC-s...
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第3篇：用MACS2軟件call peaks學(xué)習(xí)目標： 學(xué)會用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的結(jié)果 Peak Calling Peak callin...
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BETA轉(zhuǎn)錄因子與表達關(guān)聯(lián)分析今天介紹和測試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件，BETA（Binding and Expression Target Analy...
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ATAC-Seq 數(shù)據(jù)分析（上）背景： 染色質(zhì)和染色體的結(jié)構(gòu)和功能 每一條染色單體由單個線性DNA分子組成。細胞核中的DNA是經(jīng)過高度有序的包裝，否則就是一團亂麻，不利于DNA...
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ChIP-seq詳細分析流程參考生信技能樹1以及生信技能樹2只記錄從數(shù)據(jù)下載，到最終結(jié)果展示，具體生物學(xué)知識請自行查閱稍后關(guān)于ChIP-seq的背景知識我會再發(fā)布一篇文章。...
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ATAC-seq分析實操生信技能樹健明教程放在最前面的參考鏈接：給學(xué)徒的ATAC-seq數(shù)據(jù)實戰(zhàn)（附上收費視頻) 數(shù)據(jù)來源的文章： The landscape of accessible...
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