一、組蛋白結(jié)構(gòu) 我們都知道在細(xì)胞核中的染色體是高度壓縮的，而折疊時(shí)DNA纏繞的就是組蛋白。將組蛋白區(qū)域放大，我們就會(huì)看到這樣一串念珠，組蛋白被一...
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組蛋白修飾 -
LTR_FINDER | prediction of full-length LTR retrotransposons一、簡(jiǎn)介 長(zhǎng)末端重復(fù)序列（long terminal repeated，LTR）：反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組的兩端各有一個(gè)長(zhǎng)末端重復(fù)序列(5'—LTR和...
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ltrharvest/LTRfinder計(jì)算LTR
使用gt ltrharvest計(jì)算基因組中的LTR 使用LTR_FINDER計(jì)算基因組中的LTR
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TE的鑒定轉(zhuǎn)座子鑒定方法 轉(zhuǎn)座子的鑒定方法基本歸于兩大類(lèi)：從頭預(yù)測(cè)、基于同源比對(duì)。 從頭預(yù)測(cè)算法 de novo 包括：基于基因組序列比對(duì)的方法、K-me...
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2022-06-10關(guān)于基因組LAI評(píng)估的幾點(diǎn)思考
1. LTR鑒定和LAI評(píng)估（> 5G基因組） 1）需要同時(shí)利用LTR_Finder和LTR_harvest同時(shí)鑒定，但是這兩個(gè)都是單線程，巨慢...
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入門(mén)必看 | 深度解析長(zhǎng)末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs）（轉(zhuǎn)發(fā)）入門(mén)必看 | 深度解析長(zhǎng)末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs） 諾禾致源[http://www.itdecent.cn/u/ee00dc6fa...
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