近幾年來，Hyphy的使用人數(shù)越來越來多，雖然不及paml，但這款軟件的一些優(yōu)秀特性使得它值得受到使用和關(guān)注。首先相比paml，hyphy有以下...
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Hyphy，不亞于Paml的選擇壓力分析的優(yōu)秀軟件，使用指北
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問...
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推薦一下學(xué)習(xí)進(jìn)化&生信需要的知識和資源各種網(wǎng)站https://www.biostars.org/ 各種生物信息學(xué)問題的提問，很多國外研究人員交流問題的地方https:/...
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Python爬蟲練習(xí)（一）：爬取NCBI pubmed搜索結(jié)果doi號并進(jìn)行文獻(xiàn)下載（requests+正則解析）
爬蟲是python的強項，也是其熱門應(yīng)用領(lǐng)域，有很多完善成熟的爬蟲模塊/庫，像是scrapy、selenium、beautifulsoup，以及...
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把基因畫在染色體上之前有一次，我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”，因此，我尋找了一些實現(xiàn)這個需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后，最終用ggpl...
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群體進(jìn)化-GWAS分析
群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分...
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定量蛋白組學(xué)分析流程注意：本文完全摘抄于簡書：iTRAQ定量蛋白質(zhì)組筆記(上) 僅為個人學(xué)習(xí)使用，如有侵權(quán)，請聯(lián)系刪除，謝謝！ 前言 這篇筆記是騰訊課堂上的蛋白質(zhì)組...
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軟件下載太慢,為linux,R,python,conda配置國內(nèi)源，讓你快速下載安裝大量國外軟件
在國內(nèi)很多情況下下載國外開發(fā)的軟件或者國外托管的相關(guān)的代碼庫，依賴和軟件包是最耗時最浪費精力的事情。好在國內(nèi)有不少提供軟件鏡像的網(wǎng)站，使用國內(nèi)的...
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Autodock使用小技巧
目的：完成基因與化合物的對接 步驟： 1. 安裝pymol，autodock tool，chemdraw 3d，vina腳本 2. 首先NCBI...
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使用R語言繪制人體解剖R不僅擅長做各種統(tǒng)計分析和數(shù)據(jù)建模，可以用ggplot2和其它作圖工具做出十分漂亮的各種統(tǒng)計分析展示圖，同時我發(fā)現(xiàn)R中的歌gganatogram...
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