參考學(xué)習(xí)《R語言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用》第六章 前言 Y叔的公眾號biobabble發(fā)過一篇【聽說你想學(xué)R？】,七月份發(fā)的但昨...
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Bioconductor分析RNA-seq數(shù)據(jù) -
關(guān)于世界土壤取樣標(biāo)準(zhǔn)化的一些思考
我怎么能每天站在這大地上卻感受不到它的力量？我怎么能站在這上面度過我的人生卻不想知道它？— W. B. Logan1 開始接觸微生物之后，我...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從fastq測序數(shù)據(jù)到OTU table筆記內(nèi)容：由二代測序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（fastq格式）到物種豐度的OTU table， 樣本群落距離矩陣，物種多樣性指數(shù)，序列的進化樹及物種注釋信...
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數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||聚類物種關(guān)聯(lián)組內(nèi)數(shù)據(jù)簡單統(tǒng)計 對聚類結(jié)果獲得的樣方組進行簡單統(tǒng)計（如平均多度），尋找每個樣方組數(shù)量最多，頻度最高或最具代表性的物種。 Kendall 共性系...
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組間差異檢驗，終于有人講清楚了!什么是組間差異檢驗？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗，應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)上的假設(shè)檢驗方法，檢驗組間是否有差異及其差異程度。坦率地講，所有的差異檢驗都基于...
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數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||冗余分析（RDA）上一節(jié)數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||冗余分析（RDA）概述中，我們回顧了RDA的計算過程，不管這個過程我們有沒有理解透徹，我希望你能知道的是：RDA是響應(yīng)變...
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