發(fā)簡信
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vegan::envfit基本功能的python實(shí)現(xiàn)筆記內(nèi)容：R vegan包envfit的output及其計(jì)算python實(shí)現(xiàn)：見github注意 R vegan包envfit的output及其...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：raw data sequence及其注意事項(xiàng)筆記內(nèi)容：拿到原始數(shù)據(jù)后，在做上游分析之前，需要了解和注意的：16s rRNA是什么，測它有什么用序列文件(raw sequence data)...
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python學(xué)習(xí)：零碎的內(nèi)容（二）...本來是在python學(xué)習(xí)：零碎的內(nèi)容[http://www.itdecent.cn/p/e9571b90e875]里不斷蓋樓，蓋到62條...
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plotly + Dash：探索深圳市400例新冠肺炎個案可視化筆記內(nèi)容：數(shù)據(jù)獲取用plotly(python) 實(shí)現(xiàn)400個病例來深時間，發(fā)病時間，入院時間概覽用dash實(shí)現(xiàn)上述概覽，并添加各個例性別，年齡...
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git的一些操作筆記內(nèi)容：基本的git操作參考文檔https://git-scm.com/book/en/v2/Git-Internals-Plumbing-a...
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tmap數(shù)據(jù)分析基本步驟和結(jié)果解析筆記內(nèi)容以iris(鳶尾花)數(shù)據(jù)集為例，tmap各步驟input, output,結(jié)果解讀，參數(shù)調(diào)整和選取。包括以下腳本：envfit_anal...
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上傳序列數(shù)據(jù)到SRA筆記內(nèi)容：SRA是什么，點(diǎn)解要向它上傳序列數(shù)據(jù)上傳之前的準(zhǔn)備如何上傳 SRA是什么，點(diǎn)解要向它提交序列數(shù)據(jù) SRA官方document.Sequ...
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微生物組數(shù)據(jù)挖掘新方法tmap關(guān)鍵詞：微生物組大數(shù)據(jù)，population-scale，網(wǎng)絡(luò)分析，基于拓?fù)鋵W(xué)的數(shù)據(jù)挖掘新方法 本文提綱：微生物組大數(shù)據(jù)分析目前存在的問題tma...
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python畫圖：Plotly學(xué)習(xí)筆記本次筆記內(nèi)容plotly基本用法基本Scatter示例：go.Scatter()，按連續(xù)型/分類型變量著色基本Scatter示例：px()，按連...
個人介紹
成立于2016年7月，趙國屏生物信息實(shí)驗(yàn)室目前主要從事人群微生物組，微生物基因組進(jìn)化和臨床微生物流行病學(xué)的生物信息學(xué)分析，包括基因組數(shù)據(jù)的管理、基因組的比較和進(jìn)化分析、微生物組數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)和微生物流行病學(xué)模型的應(yīng)用。